RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prdm15E9Q8T2 1174 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mmp20P57748 482 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf216P58283 853 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FerP70451 823 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm29609Q3UU56 907 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rap1gap2Q5SVL6 712 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zcwpw1Q6IR42 630 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AmphQ7TQF7 686 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gtf3c2Q8BL74 907 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kdm1bQ8CIG3 826 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr390Q8VEZ7 311 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bco2Q99NF1 532 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arl8bQ9CQW2 186 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc73B2RWC4 316 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nedd9O35177 833 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dact3Q0PHV7 610 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab11fip1Q9D620 645 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scyl1Q9EQC5 806 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Speer3W4VSP1 261 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rap1gapA2ALS5 663 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myl1P05977 188 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fgfr1P16092 822 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PtpreP49446 699 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map3k7Q62073 579 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim66Q924W6 1242 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lpin3Q99PI4 848 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4933428M09RikQ9D3X3 192 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tomm20lQ9D4V6 152 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Caln1Q9JJG7 219 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hs6st3Q9QYK4 470 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3415J3QMS8 315 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prom1O54990 867 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 S100bP50114 92 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 9130409I23RikQ3TS87 320 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grb10Q60760 621 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q6GQV0 436 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TdrkhQ80VL1 560 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tyw3Q8BSA9 257 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Coq6Q8R1S0 476 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Emc2Q9CRD2 297 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rex1bdQ9CYZ6 169 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Polr3cQ9D483 533 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3404Q9D506 307 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttc33Q9D6K7 262 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Diaph3Q9Z207 1171 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc8a3S4R2P9 928 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rtl9Q32KG4 1339 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lonrf1D3YY23 762 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tlk2O55047 718 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mfsd14aP70187 490 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdh8P97291 799 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 InhbaQ04998 424 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ece1Q4PZA2 769 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grid1Q61627 1009 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Orai3Q6P8G8 290 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccnt2Q7TQK0 723 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q80ZQ3 298 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GlmnQ8BZM1 596 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q8CD60 292 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pnpt1Q8K1R3 783 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tasp1Q8R1G1 420 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fgd4Q91ZT5 766 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Foxp3Q99JB6 429 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttc6G3UYY4 1857 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GckP52792 465 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RalgdsQ03385 852 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igsf9Q05BQ1 1179 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PolnQ7TQ07 864 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 St13Q99L47 371 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RarbP22605 482 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fen1P39749 378 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb14Q08376 449 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8773Q3UQ24 132 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sema5bQ60519 1093 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nlrp4eQ66X19 978 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 N4bp1Q6A037 893 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 OcrlQ6NVF0 900 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hmgb4Q6P8W9 181 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim35Q8C006 501 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ephb1Q8CBF3 984 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sec63Q8VHE0 760 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc22Q9JIG7 627 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myh9Q8VDD5 1960 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm29133A0A1B0GT72 266 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grik3B1AS29 919 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TdgP56581 421 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Thumpd3P97770 505 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GsapQ3TCV3 858 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Parp6Q6P6P7 630 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snapc2Q91XA5 359 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp6v1b1Q91YH6 513 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AslQ91YI0 464 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.2 ms