RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A YRB1P41920 201 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A GRX5Q02784 150 aa-0.54□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A ROM2P51862 1356 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A SPS18P32572 300 aa-0.55□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A ERG28P40030 148 aa-0.55□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A CIN5P40917 295 aa-0.55□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A KIN28P06242 306 aa-0.56□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A NTG1P31378 399 aa-0.56□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A CLG1P35190 452 aa-0.56□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A YCR087C-AP37263 153 aa-0.56□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A YER085CP40058 173 aa-0.56□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A TDA4P47153 279 aa-0.56□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A DML1Q03652 475 aa-0.56□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A YLR031WQ07978 186 aa-0.56□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A YOR072WQ08486 104 aa-0.56□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A ATG41Q12048 136 aa-0.56□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A DAS2Q12084 232 aa-0.56□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A YDR157WA0A023PZE8 133 aa-0.58□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A ASF2P32448 525 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A YNL194CP40169 301 aa-0.58□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A RFC4P40339 323 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A YFL019CP43576 117 aa-0.58□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A MGR2Q02889 113 aa-0.58□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A SEN15Q04675 128 aa-0.58□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A YOR342CQ12182 319 aa-0.58□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A ATP20Q12233 115 aa-0.58□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A NCB2Q92317 146 aa-0.58□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A NSA2P40078 261 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A MOB1P40484 314 aa-0.59□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A RPS29BP41058 56 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A AVO2Q04749 426 aa-0.59□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YMR001C-AYMR001C-A PRP18P33411 251 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A RRT1P38192 103 aa-0.6□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A NHP6BP11633 99 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A STE18P18852 110 aa-0.61□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.61□□□□□ -2.51not detected
YMR001C-AYMR001C-A CBT1P36038 271 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A FMP23P38231 175 aa-0.61□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A APS3P47064 194 aa-0.61□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A TMA22P47089 198 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A RAD17P48581 401 aa-0.61□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A NRK1P53915 240 aa-0.61□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A LAA1P39526 2014 aa-0.61□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A IKI1P38874 309 aa-0.62□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A CWC23P52868 283 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A INO80P53115 1489 aa-0.62□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A HAP2P06774 265 aa-0.63□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A MRS1P07266 363 aa-0.63□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A RFC2P40348 353 aa-0.63□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A CCC1P47818 322 aa-0.63□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A HRD1Q08109 551 aa-0.63□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A VAM10Q08474 114 aa-0.63□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A YOR381W-AQ3E804 55 aa-0.63□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A OTU1P43558 301 aa-0.64□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A SBH1P52870 82 aa-0.64□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A YLR412C-AQ3E742 68 aa-0.64□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A URA2P07259 2214 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A UBC6P33296 250 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A HTD2P38790 280 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A NSG1P38837 291 aa-0.65□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A RTR1P40084 226 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A GPI17Q04080 534 aa-0.65□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A RIM9Q04734 239 aa-0.65□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A RUD3Q12234 484 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A CDC39P25655 2108 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YMR001C-AYMR001C-A CDC33P07260 213 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.66□□□□□ -2.52not detected
YMR001C-AYMR001C-A YBR027CP38220 110 aa-0.66□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A YHR140WP38842 239 aa-0.66□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A COQ1P18900 473 aa-0.67□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A SLM6P38343 150 aa-0.67□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A YNL184CP53876 108 aa-0.67□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A GAL83Q04739 417 aa-0.67□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A YDL157CQ12082 118 aa-0.67□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A RFA3P26755 122 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A ADE1P27616 306 aa-0.68□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A SNF2P22082 1703 aa-0.69□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A TAF2P23255 1407 aa-0.69□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A HSP30P25619 332 aa-0.69□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A YOR034C-AQ3E735 80 aa-0.69□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A YGR269WP40326 108 aa-0.7□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A YML079WQ03629 201 aa-0.7□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A PAC10P48363 199 aa-0.71□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A GEP7P53171 287 aa-0.71□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A PGA1P53896 198 aa-0.71□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A YPR014CQ6B0W2 109 aa-0.71□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A BNI1P41832 1953 aa-0.72□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A GLC8P41818 229 aa-0.72□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A MMS2P53152 137 aa-0.72□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A VPS28Q02767 242 aa-0.72□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A IGO2Q9P305 131 aa-0.72□□□□□ -2.52
YMR001C-AYMR001C-A SEC14P24280 304 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.4 ms