RNA–Protein interactions for RNA: YLL009C

COX17, Transcript of Copper metallochaperone that transfers copper to Sco1p and Cox11p, yeast

Gene COX17, Length 210 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COX17	YLL009C	MIM1	Q08176	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	ATX2	Q12067	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	SRB6	P32570	121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	RCN1	P36054	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	WSC2	P53832	503 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	OSH6	Q02201	448 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	SLD7	Q08457	257 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	HAP3	P13434	144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	RPB5	P20434	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YIL012W	P40551	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	PHS1	P40857	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	PIR3	Q03180	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	ADD37	Q03233	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	COA4	Q05809	96 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	RAD28	Q12021	506 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	COX10	P21592	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	ERG2	P32352	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YIL152W	P40455	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	GAT4	P40569	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YFR045W	P43617	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	EST3	Q03096	181 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	RCE1	Q03530	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	SWC7	Q06707	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	BET1	P22804	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YCR025C	P25352	136 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	OM14	P38325	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	IPT1	P38954	527 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	IRC22	P40006	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YIL059C	P40520	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	GEP7	P53171	287 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	FIT1	Q04433	528 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YMR103C	Q04436	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	TMA10	Q06177	86 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	MRS4	P23500	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	VMA11	P32842	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
COX17	YLL009C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	SHE1	P38200	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	TEM1	P38987	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	SYS1	P41544	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YGL262W	P53054	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YOL014W	Q08110	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	BSC1	Q12140	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	CCH1	P50077	2039 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	PDR10	P51533	1564 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	ATG2	P53855	1592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YAR029W	P39549	74 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YER188W	P40103	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	TIR3	P40552	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	SPG1	P50088	95 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YSP2	Q06681	1438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	SMC4	Q12267	1418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COX17	YLL009C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX17	YLL009C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX17	YLL009C	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX17	YLL009C	MIX23	P38162	196 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX17	YLL009C	MOH1	P38191	138 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX17	YLL009C	MPM1	P40364	252 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX17	YLL009C	PAM16	P42949	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX17	YLL009C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
COX17	YLL009C	CLD1	P53264	445 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX17	YLL009C	SAY1	P53324	424 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COX17	YLL009C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
COX17	YLL009C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
COX17	YLL009C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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