RNA–Protein interactions for RNA: YKR055W

RHO4, Transcript of Non-essential small GTPase, yeast

Gene RHO4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RHO4	YKR055W	ERV1	P27882	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	SAS2	P40963	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	PRY1	P47032	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	YJL028W	P47062	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	BSC1	Q12140	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	ICT1	Q12385	394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	CDC43	P18898	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	YSC83	P32792	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	VMA11	P32842	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	SDS24	P38314	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	SLM6	P38343	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	PAM16	P42949	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	CAB4	P53332	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	PGA1	P53896	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	YML079W	Q03629	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	JID1	Q12350	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	KTI11	Q3E840	82 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	MRS1	P07266	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	SEC11	P15367	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	PHO85	P17157	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	RPB8	P20436	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	MAK32	P23060	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	SRP21	P32342	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
RHO4	YKR055W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	PAU24	P38155	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	IML3	P38265	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	RPB11	P38902	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	YER134C	P40081	178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	YFR045W	P43617	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	OST2	P46964	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	LCB3	P47013	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	YJR124C	P47159	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	UBC11	P52492	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	YIP5	P53108	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	WSC2	P53832	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	UPS1	Q05776	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	RXT3	Q07458	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	UBA3	Q99344	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	STT4	P37297	1900 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RHO4	YKR055W	HEM2	P05373	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	CHO1	P08456	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PRO1	P32264	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	SKN1	P33336	771 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	CTF8	P38877	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	TEM1	P38987	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	GEP7	P53171	287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	TAM41	P53230	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAU12	P53343	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	IZH1	Q03419	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	HLR1	Q04429	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	RRT7	Q07829	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	ATG40	Q99325	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	HEM4	P06174	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PDE1	P22434	369 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	RPB7	P34087	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YBR292C	P38357	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	GLE2	P40066	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	UBX6	P47049	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	EMC4	P53073	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	IRC15	Q02733	499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	STP4	Q07351	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	OPI3	P05375	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAU2	P32612	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	CUP9	P41817	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	GON7	P46984	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	GRX8	Q05926	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	HNT3	Q08702	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	ATO3	Q12359	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	LAA1	P39526	2014 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	ECM12	O13529	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.9 ms