RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSZ1	YHR064C	YCR007C	P25354	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YKL187C	P34231	750 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	MIX23	P38162	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	QDR3	P38227	689 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YMR262W	P38430	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YHR210C	P38893	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YIL169C	P40442	995 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	REE1	P40893	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	NCE103	P53615	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	BOR1	P53838	576 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	CWC27	Q02770	301 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	UPS1	Q05776	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	CNL1	Q06333	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	PAU23	Q07987	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YOR105W	Q08504	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	THI72	Q08579	599 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	PAU17	Q12370	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	TAO3	P40468	2376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	MSI1	P13712	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	FCY2	P17064	533 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	CWP1	P28319	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	HMX1	P32339	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	AME1	P38313	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	DOG1	P38774	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	HIT1	P46973	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YNR064C	P53750	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	DUG3	P53871	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	RIM9	Q04734	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	NAT3	Q06504	195 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	LOA1	Q06508	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YFH1	Q07540	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	LDS2	Q08218	356 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	NAT5	Q08689	176 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	AKR2	Q12013	749 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	BOL1	Q3E793	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	VPS63	O13549	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YCR006C	P25350	157 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	MCH2	P36032	473 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	PMU1	P36069	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	RPA43	P46669	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	MRPL19	P53875	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	TRI1	Q05024	226 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	ARR3	Q06598	404 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	SWT1	Q12104	458 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	COX1	P00401	534 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	YMR31	P19955	123 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	IMP1	P28627	190 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	DER1	P38307	211 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	CFD1	P40558	293 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	CPD1	P53314	239 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	SDC1	Q03323	175 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	IZH1	Q03419	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	ERG8	P24521	451 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	ROX3	P25046	220 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	FPR2	P32472	135 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	ICS2	P38284	255 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	SRP14	P38985	146 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	PCL7	P40186	285 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	SAS2	P40963	338 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	XPT1	P47165	209 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	MIC27	P50945	234 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	YGR151C	P53287	111 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	NDE2	Q07500	545 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	YOL118C	Q08259	102 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	USV1	Q12132	391 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	QRI5	P32344	111 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	UTR5	P32630	166 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	DFG10	P40526	253 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	EGT2	P42835	1041 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	SHH3	Q04487	196 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSZ1	YHR064C	FIT3	Q08907	204 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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