RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C TRM732Q03496 1420 aa5.08□□□□□ -1.6
SHO1YER118C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SHO1YER118C RRT13P40042 185 aa5.08□□□□□ -1.6
SHO1YER118C YOL014WQ08110 124 aa5.08□□□□□ -1.6
SHO1YER118C YLR099W-AQ3E798 87 aa5.08□□□□□ -1.6
SHO1YER118C YAL067W-AQ8TGK6 75 aa5.08□□□□□ -1.6
SHO1YER118C YIL177CP40434 1758 aa5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C YJL225CP40889 1758 aa5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C ATP5P09457 212 aa5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C TIR1P10863 254 aa5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C RCN1P36054 211 aa5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C COS8P38723 381 aa5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C YER181CP40097 107 aa5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C PRE5P40302 234 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C FCY1Q12178 158 aa5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C YNL162W-AQ3E7A8 72 aa5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C YML100W-AQ8TGT0 57 aa5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C CCH1P50077 2039 aa5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C VTH1P40438 1549 aa5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C VTH2P40890 1549 aa5.07□□□□□ -1.6
SHO1YER118C REP2P03872 296 aa5.06□□□□□ -1.6
SHO1YER118C CBP6P07253 162 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SHO1YER118C LHP1P33399 275 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SHO1YER118C TRS20P38334 175 aa5.06□□□□□ -1.6
SHO1YER118C GLR1P41921 483 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SHO1YER118C YFL019CP43576 117 aa5.06□□□□□ -1.6
SHO1YER118C CAX4P53223 239 aa5.06□□□□□ -1.6
SHO1YER118C APJ1P53940 528 aa5.06□□□□□ -1.6
SHO1YER118C ATG39Q06159 398 aa5.06□□□□□ -1.6
SHO1YER118C PSF1Q12488 208 aa5.06□□□□□ -1.6
SHO1YER118C FMP49A0A023PZB3 126 aa5.05□□□□□ -1.6
SHO1YER118C SGA1P08019 549 aa5.05□□□□□ -1.6
SHO1YER118C NMT1P14743 455 aa5.05□□□□□ -1.6
SHO1YER118C ATP15P21306 62 aa5.05□□□□□ -1.6
SHO1YER118C PRE7P23724 241 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SHO1YER118C VMA11P32842 164 aa5.05□□□□□ -1.6
SHO1YER118C PTC1P35182 281 aa5.05□□□□□ -1.6
SHO1YER118C GPI18P38211 433 aa5.05□□□□□ -1.6
SHO1YER118C FCY21P40039 528 aa5.05□□□□□ -1.6
SHO1YER118C NAT3Q06504 195 aa5.05□□□□□ -1.6
SHO1YER118C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SHO1YER118C NUP170P38181 1502 aa5.04□□□□□ -1.6
SHO1YER118C PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SHO1YER118C HYM1P32464 399 aa5.04□□□□□ -1.6
SHO1YER118C GPI2P46961 280 aa5.04□□□□□ -1.6
SHO1YER118C YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SHO1YER118C SPC3Q12133 184 aa5.04□□□□□ -1.6
SHO1YER118C IES3Q12345 250 aa5.04□□□□□ -1.6
SHO1YER118C TAD3Q9URQ3 322 aa5.04□□□□□ -1.6
SHO1YER118C DNF1P32660 1571 aa5.04□□□□□ -1.6
SHO1YER118C TOM40P23644 387 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SHO1YER118C SRP21P32342 167 aa5.03□□□□□ -1.6
SHO1YER118C SPT14P32363 452 aa5.03□□□□□ -1.6
SHO1YER118C YNL200CP40165 246 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SHO1YER118C ULS1Q08562 1619 aa5.03□□□□□ -1.6
SHO1YER118C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SHO1YER118C TY1B-ER2Q03619 1755 aa5.03□□□□□ -1.6
SHO1YER118C TY1B-MR1Q04214 1755 aa5.03□□□□□ -1.6
SHO1YER118C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SHO1YER118C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SHO1YER118C TY1B-NL1Q12112 1755 aa5.03□□□□□ -1.6
SHO1YER118C TY1B-GR1Q12141 1755 aa5.03□□□□□ -1.6
SHO1YER118C TY1B-BLQ12490 1755 aa5.03□□□□□ -1.6
SHO1YER118C MLP2P40457 1679 aa5.02□□□□□ -1.61
SHO1YER118C BUD23P25627 275 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
SHO1YER118C YER134CP40081 178 aa5.02□□□□□ -1.61
SHO1YER118C RSM27P53305 110 aa5.02□□□□□ -1.61
SHO1YER118C CWC27Q02770 301 aa5.02□□□□□ -1.61
SHO1YER118C RSM10Q03201 203 aa5.02□□□□□ -1.61
SHO1YER118C YPR114WQ06107 315 aa5.02□□□□□ -1.61
SHO1YER118C YOR214CQ12282 236 aa5.02□□□□□ -1.61
SHO1YER118C BOL1Q3E793 110 aa5.02□□□□□ -1.61
SHO1YER118C YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa5.02□□□□□ -1.61
SHO1YER118C YBR298C-AQ8TGK4 73 aa5.02□□□□□ -1.61
SHO1YER118C RPL9AP05738 191 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SHO1YER118C COX10P21592 462 aa5.01□□□□□ -1.61
SHO1YER118C SNC2P33328 115 aa5.01□□□□□ -1.61
SHO1YER118C FMP46P36141 133 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SHO1YER118C SWD3P38123 315 aa5.01□□□□□ -1.61
SHO1YER118C YHR140WP38842 239 aa5.01□□□□□ -1.61
SHO1YER118C RPL9BP51401 191 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SHO1YER118C SAE3P89114 91 aa5.01□□□□□ -1.61
SHO1YER118C SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SHO1YER118C YLR118CQ12354 227 aa5.01□□□□□ -1.61
SHO1YER118C FLO11P08640 1367 aa5.01□□□□□ -1.61
SHO1YER118C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SHO1YER118C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SHO1YER118C ADK1P07170 222 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SHO1YER118C SHB17P36136 271 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SHO1YER118C VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data5□□□□□ -1.61not detected
SHO1YER118C YGR017WP53210 297 aa5□□□□□ -1.61
SHO1YER118C YNL033WP53964 284 aa5□□□□□ -1.61
SHO1YER118C YNL019CP53975 284 aa5□□□□□ -1.61
SHO1YER118C AIM36Q03798 255 aa5□□□□□ -1.61
SHO1YER118C YMR253CQ04835 414 aa5□□□□□ -1.61
SHO1YER118C YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SHO1YER118C YOL085CQ99345 113 aa5□□□□□ -1.61
SHO1YER118C DDI2P0CH63 225 aa4.99□□□□□ -1.61
SHO1YER118C DDI3P0CH64 225 aa4.99□□□□□ -1.61
SHO1YER118C PHO13P19881 312 aa4.99□□□□□ -1.61
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