RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 FCARP24071 287 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 NPTX2P47972 431 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 LIMK1P53667 647 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 SPECC1Q5M775 1068 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 BRAPQ7Z569 592 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 SRLQ86TD4 932 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 BRD9Q9H8M2 597 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 DSEQ9UL01 958 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 GDAQ9Y2T3 454 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF263O14978 683 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CLCN6P51797 869 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 MCL1Q07820 350 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ZSCAN26Q16670 478 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 SPATA18Q8TC71 538 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 KXD1Q9BQD3 176 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 POLIQ9UNA4 740 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ADAM12O43184 909 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 BMP15O95972 392 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 PIGRP01833 764 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 PLS3P13797 630 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 EPHB3P54753 998 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 NTHL1P78549 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 AMPD2Q01433 879 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 PTGDRQ13258 359 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 FZD5Q13467 585 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 YAF2Q8IY57 180 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 DDX12PQ92771 950 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 AK8Q96MA6 479 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC169A6NNP5 214 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ABLIM1O14639 778 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 SLC30A4O14863 429 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CEBPBP17676 345 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 UBE2HP62256 183 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 GPR17Q13304 367 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CSRP2Q16527 193 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 C11orf74Q86VG3 221 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 LONP2Q86WA8 852 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 HASPINQ8TF76 798 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 FAM3CQ92520 227 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ATG13O75143 517 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 HIP1RO75146 1068 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CYP11A1P05108 521 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CDC25AP30304 524 aa6.49□□□□□ -1.37
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