RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 CYP26A1O43174 497 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 MGEA5O60502 916 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SGPL1O95470 568 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CD4P01730 458 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 KRT5P13647 590 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 GUCY2FP51841 1108 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 VAV2P52735 878 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 DMPKQ09013 629 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB6Q15916 424 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 XKR4Q5GH76 650 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 VPS36Q86VN1 386 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 UBR7Q8N806 425 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 KLK14Q9P0G3 267 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 A0A087X0T9 212 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 FAM228BP0C875 321 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 KCNE1P15382 129 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP25P42331 645 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ASPAP45381 313 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 KRT222Q8N1A0 295 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 BEST2Q8NFU1 509 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ARMC5Q96C12 935 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 AGPAT1Q99943 283 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 NENFQ9UMX5 172 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 IKBKGQ9Y6K9 419 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 RCCD1A6NED2 376 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 HOXA2O43364 376 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ABL1P00519 1130 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ITGA4P13612 1032 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 RAB27AP51159 221 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 RBP5P82980 135 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 MBTPS1Q14703 1052 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 HACE1Q8IYU2 909 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 POLIQ9UNA4 740 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TFR2Q9UP52 801 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 BRCA2P51587 3418 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TUBB4AP04350 444 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SELPP16109 830 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TNFAIP3P21580 790 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 MAGEA1P43355 309 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PDE6CP51160 858 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 BFSP2Q13515 415 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 LONRF1Q17RB8 773 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 HPDLQ96IR7 371 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 BCO2Q9BYV7 579 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 RNF19AQ9NV58 838 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TRIM10Q9UDY6 481 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.45□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CFAP69A5D8W1 941 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms