RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283206.8

TMEM87B-201, Transcript of transmembrane protein 87B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TMEM87B, Length 5,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87B-201ENST00000283206 PDHA1P08559 390 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 NCAM1P13591 858 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ERO1BQ86YB8 467 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MUC3BQ9H195 1237 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 TMX2Q9Y320 296 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ASMTLO95671 621 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 POLBP06746 335 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CHN1P15882 459 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CALML6Q8TD86 181 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ARP10275 920 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SEC23AQ15436 765 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 C4orf22Q6V702 233 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CARSP49589 748 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 PTK7Q13308 1070 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CHSY1Q86X52 802 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 RUBCNLQ9H714 662 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 AKT1P31749 480 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 NAMPTP43490 491 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 GTF2A2P52657 109 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 PCSK7Q16549 785 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 A0A087X0T9 212 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ANGPT2O15123 496 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 FAM228BP0C875 321 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 PGM1P36871 562 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ITGA8P53708 1063 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 KDSRQ06136 332 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 HIC1Q14526 733 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 THAP2Q9H0W7 228 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 EPN3Q9H201 632 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 TASP1Q9H6P5 420 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 DPP3Q9NY33 737 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SREBF2Q12772 1141 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 TWF1Q12792 350 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 RNF180Q86T96 592 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 COG4Q9H9E3 785 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ELMO2Q96JJ3 720 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ISCUQ9H1K1 167 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 USP32Q8NFA0 1604 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ZNF263O14978 683 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 IL10P22301 178 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 PON1P27169 355 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 EPHB2P29323 1055 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 NPTX2P47972 431 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SEZ6Q53EL9 994 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 IPMKQ8NFU5 416 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 FOPNLQ96NB1 174 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MROH8Q9H579 483 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 HPSEQ9Y251 543 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CLCN3P51790 818 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 GTF2H3Q13889 308 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 RRM2BQ7LG56 351 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms