RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	SIP1	P32578	815 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	PRY2	P36110	329 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	COX15	P40086	486 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	DFG10	P40526	253 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	TAX4	P47030	604 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	TIM44	Q01852	431 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	MCH1	Q07376	486 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	MSA1	Q08471	629 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	RPD3	P32561	433 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	PHM8	P40025	321 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	RFC2	P40348	353 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	AGX1	P43567	385 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	TAD2	P47058	250 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	ERG25	P53045	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	CRH1	P53301	507 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	MRPL50	P53724	139 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	DUG3	P53871	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	SPG4	Q04438	115 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	AEP3	Q12089	606 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YCR025C	P25352	136 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YBR184W	P38299	523 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YEA4	P40004	342 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	LST8	P41318	303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	PKP2	P53170	491 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	PDR17	P53844	350 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	DID2	P69771	204 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YML122C	Q03207	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	PRR2	Q12310	699 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	JID1	Q12350	301 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	HXT14	P42833	540 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YGL117W	P53133	265 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YGR219W	P53307	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	DCS1	Q06151	350 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YKL102C	P34249	101 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YCR041W	P37265	110 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	WSS1	P38838	269 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YGR269W	P40326	108 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	SRB7	P47822	140 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	DYN2	Q02647	92 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	LAS17	Q12446	633 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	DYN1	P36022	4092 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	FCY2	P17064	533 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	QDR3	P38227	689 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	CSH1	P38287	376 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YNL194C	P40169	301 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	VPS55	P47111	140 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	BUL1	P48524	976 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	AGC1	Q12482	902 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	MRS3	P10566	314 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	DOG2	P38773	246 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	DOG1	P38774	246 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	VMA22	P38784	181 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YAR068W	P39564	161 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	FIP1	P45976	327 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	SNX4	P47057	423 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YGR018C	P53211	109 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	ORM1	P53224	222 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	BOR1	P53838	576 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	PLP1	Q04004	230 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	USV1	Q12132	391 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	AHT1	P29589	182 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	UPS2	P35200	230 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66

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