RNA–Protein interactions for RNA: YML103C

NUP188, Transcript of Subunit of the inner ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP188, Length 4,968 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP188	YML103C	YNL217W	P40152	326 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	PRM10	P42946	383 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	GRX8	Q05926	109 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	YDL012C	Q12489	107 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	SPO13	P23624	291 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	GAS3	Q03655	524 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	FIG1	P38224	298 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	SNO1	Q03144	224 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	SHH3	Q04487	196 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	DGA1	Q08650	418 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	MET5	P47169	1442 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	TIR3	P40552	269 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	YNR062C	P53748	327 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	ANT1	Q06497	328 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	VPS68	Q12016	184 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	YDL180W	Q12301	547 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.9	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	DSE2	P38844	325 aa		0.9	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	SLM2	P53955	656 aa		0.9	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	RAV2	Q03956	351 aa		0.9	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	ATO3	Q12359	275 aa		0.9	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	RDI1	Q12434	202 aa		0.9	□□□□□ -2.26
NUP188	YML103C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YKL102C	P34249	101 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	OPY1	P38271	328 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	DER1	P38307	211 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	PEP8	P40335	379 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	CUP9	P41817	306 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YIP3	P53633	176 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	DGK1	Q12382	290 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	FZF1	P32805	299 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.9	□□□□□ -2.27	not detected
NUP188	YML103C	RFC2	P40348	353 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	SFK1	P35735	353 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	AME1	P38313	324 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	PET191	Q02772	108 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	HRT1	Q08273	121 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	PHO85	P17157	305 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	ATP15	P21306	62 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	DLS1	P40366	167 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YDR391C	Q04170	232 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YOR015W	Q12169	119 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	ATP14	Q12349	124 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	APA2	P22108	325 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YHR022C	P38763	256 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	AYR1	P40471	297 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	PAC10	P48363	199 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	MAK31	P23059	88 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	SOK1	P40317	901 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YFH7	P43591	353 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	CCC1	P47818	322 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	HHT1	P61830	136 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	VPS28	Q02767	242 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	DAS2	Q12084	232 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YER076C	P40049	302 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	TTI2	P47168	421 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YOR214C	Q12282	236 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	ATP19	P81451	68 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	DDI2	P0CH63	225 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	DDI3	P0CH64	225 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	FCY21	P40039	528 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	AGE2	P40529	298 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YOL160W	Q08321	113 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	HSP30	P25619	332 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	SPC25	P40014	221 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	SBH2	P52871	88 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	BOL2	P53082	120 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YGL101W	P53144	215 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	CYT2	Q00873	224 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	RAD6	P06104	172 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	SEC11	P15367	167 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	POP7	P38291	140 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YER084W	P40057	128 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	PIR5	P46999	287 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP188	YML103C	YJR146W	P47174	117 aa		0.88	□□□□□ -2.27

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