RNA–Protein interactions for RNA: YKR082W

NUP133, Transcript of Subunit of Nup84p subcomplex of nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP133, Length 3,474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP133	YKR082W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	THP1	Q08231	455 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YPR064W	Q12492	139 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SNF4	P12904	322 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	FMT1	P32785	401 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	TRS65	P32893	560 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MIT1	P40002	666 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YFR054C	P43622	192 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SBH1	P52870	82 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YGR219W	P53307	113 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	LAS17	Q12446	633 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	CYC7	P00045	113 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	HAP3	P13434	144 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	STE4	P18851	423 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YNL033W	P53964	284 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	ARK1	P53974	638 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YNL019C	P53975	284 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	GPI11	Q06636	219 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	PRR2	Q12310	699 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	KTI11	Q3E840	82 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	POP8	P38208	133 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	ERG25	P53045	309 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YGL230C	P53074	147 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RIM8	P53179	542 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	DGA1	Q08650	418 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SGA1	P08019	549 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	CPR3	P25719	182 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	PEX2	P32800	271 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YBR090C	P38253	122 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	FAA2	P39518	744 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SWC7	Q06707	132 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	AIM39	Q08223	395 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	FLO11	P08640	1367 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
NUP133	YKR082W	YPT10	P38146	199 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	LAG1	P38703	411 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	TIR3	P40552	269 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	DAN1	P47178	298 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	VHT1	P53241	593 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
NUP133	YKR082W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MCA1	Q08601	432 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	HUT1	Q12520	339 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	PTM1	P32857	523 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YIL024C	P40543	189 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YNL234W	P53857	426 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RNH201	P53942	307 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	BET5	Q03630	159 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SLD7	Q08457	257 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	FCY1	Q12178	158 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YPS3	Q12303	508 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	INO4	P13902	151 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	PEX17	P40155	199 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SNN1	P48232	102 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SPG4	Q04438	115 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	GAL83	Q04739	417 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MCT1	Q12283	360 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RAD6	P06104	172 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YMC1	P32331	307 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	APS1	P35181	156 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	TEM1	P38987	245 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YEL075C	P39972	122 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	HMS2	P47175	358 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YIP4	P53093	235 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	TIR1	P10863	254 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	STF2	P16965	84 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YKL097C	P34245	136 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	FIS1	P40515	155 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	AIM25	P47140	327 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SEN15	Q04675	128 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	UPS1	Q05776	175 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	TMA10	Q06177	86 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YPL162C	Q12042	273 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SUT2	Q12286	268 aa		3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27 ms