RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP4	YHR069C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	EST3	Q03096	181 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	HOF1	Q05080	669 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	FCY1	Q12178	158 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	COA2	Q3E823	68 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	ISN1	Q99312	450 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	PDC2	P32896	925 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YEA6	P39953	335 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YJL213W	P40896	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	GPI15	P53961	229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	ANT1	Q06497	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	PAM18	Q07914	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YNG1	Q08465	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	AEP3	Q12089	606 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	ERV1	P27882	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	AGX1	P43567	385 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YJR056C	P47115	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	ECM27	P47144	725 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YGR050C	P53231	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YGR151C	P53287	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	MRPL50	P53724	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	PLP1	Q04004	230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	FSH2	Q05015	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	COA4	Q05809	96 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YCR025C	P25352	136 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	SRY1	P36007	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	DFG10	P40526	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	BNA1	P47096	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YGL117W	P53133	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	HCH1	P53834	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YMR082C	Q04276	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	CCW14	O13547	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	ECM31	P38122	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	SLM6	P38343	150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	PSD1	P39006	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	PHM8	P40025	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	PKP2	P53170	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	JAC1	P53193	184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	DID2	P69771	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	MCH1	Q07376	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	RXT3	Q07458	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	USV1	Q12132	391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	RPD3	P32561	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	TIM44	Q01852	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YPS3	Q12303	508 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	PHO85	P17157	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	SIP1	P32578	815 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YEA4	P40004	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	COX15	P40086	486 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YER188W	P40103	239 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	SWM2	P40342	146 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YIP1	P53039	248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	ORM1	P53224	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	DYN2	Q02647	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YML122C	Q03207	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	PRR2	Q12310	699 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	JID1	Q12350	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	ATG31	Q12421	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	FMP16	Q12497	93 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP4	YHR069C	MRS3	P10566	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	LST8	P41318	303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	YJL163C	P46996	555 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	PDR17	P53844	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP4	YHR069C	DCS1	Q06151	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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