RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W MRP10O75012 95 aa7.29□□□□□ -1.24
DDI1YER143W ECM31P38122 312 aa7.29□□□□□ -1.24
DDI1YER143W DFG10P40526 253 aa7.29□□□□□ -1.24
DDI1YER143W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDI1YER143W YGL114WP53134 725 aa7.29□□□□□ -1.24
DDI1YER143W CRH1P53301 507 aa7.29□□□□□ -1.24
DDI1YER143W HCH1P53834 153 aa7.29□□□□□ -1.24
DDI1YER143W APJ1P53940 528 aa7.29□□□□□ -1.24
DDI1YER143W STD1Q02794 444 aa7.29□□□□□ -1.24
DDI1YER143W ODC1Q03028 310 aa7.29□□□□□ -1.24
DDI1YER143W MIX17Q03667 156 aa7.29□□□□□ -1.24
DDI1YER143W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa7.29□□□□□ -1.24
DDI1YER143W YDR157WA0A023PZE8 133 aa7.28□□□□□ -1.24
DDI1YER143W YHL044WP38727 235 aa7.28□□□□□ -1.24
DDI1YER143W PDR17P53844 350 aa7.28□□□□□ -1.24
DDI1YER143W RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
DDI1YER143W ARR2Q06597 130 aa7.28□□□□□ -1.24
DDI1YER143W IRC25Q07951 179 aa7.28□□□□□ -1.24
DDI1YER143W CSI2Q08054 341 aa7.28□□□□□ -1.24
DDI1YER143W SPO24Q3E752 67 aa7.28□□□□□ -1.24
DDI1YER143W PMU1P36069 295 aa7.27□□□□□ -1.25
DDI1YER143W PSD1P39006 500 aa7.27□□□□□ -1.25
DDI1YER143W EMC5P40540 141 aa7.27□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YCL001W-AP87012 153 aa7.27□□□□□ -1.25
DDI1YER143W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YPR071WQ12346 211 aa7.27□□□□□ -1.25
DDI1YER143W ATP3P38077 311 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
DDI1YER143W COX15P40086 486 aa7.26□□□□□ -1.25
DDI1YER143W SNN1P48232 102 aa7.26□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YNL234WP53857 426 aa7.26□□□□□ -1.25
DDI1YER143W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
DDI1YER143W USV1Q12132 391 aa7.26□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YPS3Q12303 508 aa7.26□□□□□ -1.25
DDI1YER143W ATO3Q12359 275 aa7.26□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YGL258W-AQ3E740 77 aa7.26□□□□□ -1.25
DDI1YER143W URA5P13298 226 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
DDI1YER143W MSN1P22148 382 aa7.25□□□□□ -1.25
DDI1YER143W TCA17P32613 152 aa7.25□□□□□ -1.25
DDI1YER143W VMA11P32842 164 aa7.25□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YGR269WP40326 108 aa7.25□□□□□ -1.25
DDI1YER143W ERG25P53045 309 aa7.25□□□□□ -1.25
DDI1YER143W FMP41P53889 259 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
DDI1YER143W DCS1Q06151 350 aa7.25□□□□□ -1.25
DDI1YER143W RAX2Q12465 1220 aa7.25□□□□□ -1.25
DDI1YER143W AGC1Q12482 902 aa7.25□□□□□ -1.25
DDI1YER143W COX19Q3E731 98 aa7.25□□□□□ -1.25
DDI1YER143W VMA9Q3E7B6 73 aa7.25□□□□□ -1.25
DDI1YER143W HBN1Q96VH4 193 aa7.25□□□□□ -1.25
DDI1YER143W ZRC1P20107 442 aa7.24□□□□□ -1.25
DDI1YER143W UPS2P35200 230 aa7.24□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YKR045CP36138 183 aa7.24□□□□□ -1.25
DDI1YER143W SPC25P40014 221 aa7.24□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YGR045CP53229 120 aa7.24□□□□□ -1.25
DDI1YER143W DYN2Q02647 92 aa7.24□□□□□ -1.25
DDI1YER143W TMA10Q06177 86 aa7.24□□□□□ -1.25
DDI1YER143W FRQ1Q06389 190 aa7.24□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YDL242WQ07746 117 aa7.24□□□□□ -1.25
DDI1YER143W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
DDI1YER143W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
DDI1YER143W GEP5Q12393 293 aa7.24□□□□□ -1.25
DDI1YER143W NOP1P15646 327 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
DDI1YER143W BGL2P15703 313 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
DDI1YER143W FCY2P17064 533 aa7.23□□□□□ -1.25
DDI1YER143W AHT1P29589 182 aa7.23□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YJR056CP47115 236 aa7.23□□□□□ -1.25
DDI1YER143W ABM1P47146 123 aa7.23□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YNR066CP53752 436 aa7.23□□□□□ -1.25
DDI1YER143W ADD37Q03233 198 aa7.23□□□□□ -1.25
DDI1YER143W Q0142Q9ZZW4 58 aa7.23□□□□□ -1.25
DDI1YER143W ADE8P04161 214 aa7.22□□□□□ -1.25
DDI1YER143W HEM13P11353 328 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
DDI1YER143W FLO5P38894 1075 aa7.22□□□□□ -1.25
DDI1YER143W PEX7P39108 375 aa7.22□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YJL213WP40896 331 aa7.22□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YMR317WQ04893 1140 aa7.22□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
DDI1YER143W YOR015WQ12169 119 aa7.22□□□□□ -1.25
DDI1YER143W HTB1P02293 131 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
DDI1YER143W YBR292CP38357 123 aa7.21□□□□□ -1.26
DDI1YER143W WSS1P38838 269 aa7.21□□□□□ -1.26
DDI1YER143W HXT14P42833 540 aa7.21□□□□□ -1.26
DDI1YER143W CAF16P43569 289 aa7.21□□□□□ -1.26
DDI1YER143W ERV25P54837 211 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
DDI1YER143W DAL4Q04895 635 aa7.21□□□□□ -1.26
DDI1YER143W FCY1Q12178 158 aa7.21□□□□□ -1.26
DDI1YER143W SOD1P00445 154 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W MRS3P10566 314 aa7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W ELO2P25358 347 aa7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W LDS1P31379 325 aa7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W MSK1P32048 576 aa7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W YBR184WP38299 523 aa7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W SHG1P38337 142 aa7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W NSA2P40078 261 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W YIL024CP40543 189 aa7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W MCM22P47167 239 aa7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W TMA23Q03525 211 aa7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W URA2P07259 2214 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DDI1YER143W CDC50P25656 391 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 87.8 ms