RNA–Protein interactions for RNA: YEL065W

SIT1, Transcript of Ferrioxamine B transporter, yeast

Gene SIT1, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIT1	YEL065W	YBR220C	P38318	560 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SIT1	YEL065W	YFR054C	P43622	192 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SIT1	YEL065W	PAC10	P48363	199 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SIT1	YEL065W	UFD1	P53044	361 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SIT1	YEL065W	TIM13	P53299	105 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SIT1	YEL065W	YDR366C	P87287	132 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SIT1	YEL065W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SIT1	YEL065W	DML1	Q03652	475 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SIT1	YEL065W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SIT1	YEL065W	RPN13	O13563	156 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	LDB16	P25587	256 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	SMP1	P38128	452 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YBR242W	P38331	238 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	COS8	P38723	381 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	HHO1	P53551	258 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	TRP1	P00912	224 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	CDC43	P18898	376 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	TKL2	P33315	681 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	AVT1	P47082	602 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YGR039W	P53225	103 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	TMA23	Q03525	211 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	Q0255	P03881	472 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	SCO2	P38072	301 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	RPA43	P46669	326 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YGL088W	P53151	121 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	VPS71	Q03433	280 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	MCH1	Q07376	486 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	ATR1	P13090	542 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	TIM17	P39515	158 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	IRC22	P40006	225 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	XPT1	P47165	209 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	AIM36	Q03798	255 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	KRE5	P22023	1365 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	PCL1	P24867	279 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	SNC2	P33328	115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YIL012W	P40551	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	FIP1	P45976	327 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	NCA3	P46955	337 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	TTI2	P47168	421 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	INP1	Q03694	420 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	ATG39	Q06159	398 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	USO1	P25386	1790 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YIL177C	P40434	1758 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YJL225C	P40889	1758 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	ATS1	P31386	333 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YHL026C	P38740	315 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	GGC1	P38988	300 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	CFD1	P40558	293 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	SER2	P42941	309 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YGR015C	P53208	328 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	AYT1	Q12226	474 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	SEC17	P32602	292 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	FLO5	P38894	1075 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	BNS1	P50084	137 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	CLD1	P53264	445 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	GAS3	Q03655	524 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	FCY1	Q12178	158 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	SHE1	P38200	338 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	LPP1	Q04396	274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	EMI1	Q04406	187 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	DGK1	Q12382	290 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	GPA2	P10823	449 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YBR063C	P38083	404 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	PHO89	P38361	574 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YER189W	P40104	122 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YPS3	Q12303	508 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	TIM22	Q12328	207 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	TIR1	P10863	254 aa		4.65	□□□□□ -1.66

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