RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 ATL2Q8NHH9 583 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 COPS5Q92905 334 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 OSBPL8Q9BZF1 889 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 CALB1P05937 261 aa24.6■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 TRPC3Q13507 836 aa24.6■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 MOGSQ13724 837 aa24.6■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.6■■□□□ 1.53
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EHD4-202ENST00000569223 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa24.6■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 CCDC114Q96M63 670 aa24.6■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 GMNCA6NCL1 334 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 TMEM191CA6NGB0 347 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 SMIM23A6NLE4 172 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 GJB1P08034 283 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 TMEM191BP0C7N4 346 aa24.59■■□□□ 1.53
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EHD4-202ENST00000569223 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.59■■□□□ 1.53
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EHD4-202ENST00000569223 RAPGEF5Q92565 580 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 FZD8Q9H461 694 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa24.59■■□□□ 1.53
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EHD4-202ENST00000569223 PPIL2Q13356 520 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 TFDP1Q14186 410 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 CCNG2Q16589 344 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 NLRP4Q96MN2 994 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 NEU2Q9Y3R4 380 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 B4GALT5O43286 388 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 ATF2P15336 505 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 CHKAP35790 457 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 ITGA8P53708 1063 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 ZNF699Q32M78 642 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 ZNF394Q53GI3 561 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 TMEM35BQ8NCS4 154 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 XYLT2Q9H1B5 865 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD4-202ENST00000569223 UTRNP46939 3433 aa24.58■■□□□ 1.53
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EHD4-202ENST00000569223 WEE2P0C1S8 567 aa24.57■■□□□ 1.52
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EHD4-202ENST00000569223 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa24.57■■□□□ 1.52
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EHD4-202ENST00000569223 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
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EHD4-202ENST00000569223 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
EHD4-202ENST00000569223 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.57■■□□□ 1.52
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EHD4-202ENST00000569223 FAM118BQ9BPY3 351 aa24.57■■□□□ 1.52
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EHD4-202ENST00000569223 EVPLQ92817 2033 aa24.56■■□□□ 1.52
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EHD4-202ENST00000569223 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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EHD4-202ENST00000569223 WDR78Q5VTH9 848 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD4-202ENST00000569223 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD4-202ENST00000569223 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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EHD4-202ENST00000569223 CEP120Q8N960 986 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD4-202ENST00000569223 CENPTQ96BT3 561 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD4-202ENST00000569223 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD4-202ENST00000569223 MCEEQ96PE7 176 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD4-202ENST00000569223 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD4-202ENST00000569223 ADCY8P40145 1251 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD4-202ENST00000569223 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
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