RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 MON1BQ7L1V2 547 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 TFAP2BQ92481 460 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 TRIM11Q96F44 468 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 PBKQ96KB5 322 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 RNF39Q9H2S5 420 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 CNTN3Q9P232 1028 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 PARP2Q9UGN5 583 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 SCN1AP35498 2009 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 CES2O00748 559 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 TNNC1P63316 161 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 ORC1Q13415 861 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 PNKPQ96T60 521 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 IPPQ9Y573 584 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 CEP104O60308 925 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 MYBL1P10243 752 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 CD19P15391 556 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 CLCN6P51797 869 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 ITIH3Q06033 890 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 ZBTB6Q15916 424 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 SESTD1Q86VW0 696 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 BEST2Q8NFU1 509 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 RPS6KA5O75582 802 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 CHRNA1P02708 482 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 PTGISQ16647 500 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 RNF180Q86T96 592 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 PPEF2O14830 753 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 RAD23BP54727 409 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 MYO1EQ12965 1108 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 TWNKQ96RR1 684 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 COMTP21964 271 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 THPOP40225 353 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 LIN9Q5TKA1 542 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 WHAMMQ8TF30 809 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 CEP350Q5VT06 3117 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 CILPO75339 1184 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 PAEPP09466 180 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 PCDHGC3Q9UN70 934 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 GNRH1P01148 92 aa22.2■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 INHAP05111 366 aa22.2■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 ACLYP53396 1101 aa22.2■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 MGAT3Q09327 533 aa22.2■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 ITGA7Q13683 1181 aa22.2■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.2■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 USP38Q8NB14 1042 aa22.2■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.2■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.2■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.2■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 TRIM7Q9C029 511 aa22.2■■□□□ 1.15
SPNS1-212ENST00000568900 PTP4A2Q12974 167 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 RPAINQ86UA6 219 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CEP83Q9Y592 693 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 MED7O43513 233 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 SPOPO43791 374 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 MMP8P22894 467 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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