RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 EHD1Q9H4M9 534 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 AZI2Q9H6S1 392 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CFL2Q9Y281 166 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 UTYO14607 1347 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MAST3O60307 1309 aa6.46□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 35.3
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF609O15014 1411 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 USP6P35125 1406 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ILVBLA1L0T0 632 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 K7EPI3 171 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CLOCKO15516 846 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 DAPK3O43293 454 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 RIPK2O43353 540 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SULT1B1O43704 296 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CDH16O75309 829 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF254O75437 659 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 GPC4O75487 556 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 TSPAN9O75954 239 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 TM7SF2O76062 418 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 BMP10O95393 424 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 FGAP02671 866 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 FUCA1P04066 466 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CAPNS1P04632 268 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SERPING1P05155 500 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 FYNP06241 537 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 LDHCP07864 332 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ABHD2P08910 425 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CALM1P0DP23 149 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CALM2P0DP24 149 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CALM3P0DP25 149 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CDC25AP30304 524 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 HOXD13P35453 343 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 FDFT1P37268 417 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 GRIK1P39086 918 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ECE1P42892 770 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CCR3P51677 355 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 C21orf59P57076 290 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 STX1BP61266 288 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ECT2LQ008S8 904 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CAV1Q03135 178 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SNAPC2Q13487 334 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 UBE4AQ14139 1066 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SPARCL1Q14515 664 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 OXA1LQ15070 435 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CRY1Q16526 586 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CEP78Q5JTW2 689 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 BEND5Q7L4P6 421 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 TDRPQ86YL5 185 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 FRS2Q8WU20 508 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 TRIB2Q92519 343 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CFAP36Q96G28 342 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 VMP1Q96GC9 406 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 FBXL18Q96ME1 805 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 SNX18Q96RF0 628 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CDRT15Q96T59 188 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ALG1Q9BT22 464 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 MTFR1LQ9H019 292 aa6.45□□□□□ -1.38
SNHG1-211ENST00000539921 CDH19Q9H159 772 aa6.45□□□□□ -1.38
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