RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF280D	Q6N043	979 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	CDH22	Q9UJ99	828 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	VAMP7	P51809	220 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	ROR1	Q01973	937 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	WSCD1	Q658N2	575 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	USP37	Q86T82	979 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	SUSD6	Q92537	303 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	HPDL	Q96IR7	371 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	WDR27	A2RRH5	827 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	ABLIM3	O94929	683 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	AP3M2	P53677	418 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	ARPP19	P56211	112 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	TTI2	Q6NXR4	508 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	NELFB	Q8WX92	580 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	DPP7	Q9UHL4	492 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	DSE	Q9UL01	958 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	IKBKB	O14920	756 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	ITIH3	Q06033	890 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	RFPL2	O75678	378 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	WEE2	P0C1S8	567 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	ENPEP	Q07075	957 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	MYO1E	Q12965	1108 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	L1RE1	Q9UN81	338 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	FAM50B	Q9Y247	325 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	OR6C75	A6NL08	312 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	PHACTR2	O75167	634 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	PAPLN	O95428	1278 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	VNN1	O95497	513 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	OR4Q2	P0C623	313 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	TRIM49	P0CI25	452 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	TRIM49C	P0CI26	452 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	KRT13	P13646	458 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	STX17	P56962	302 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	MYL6	P60660	151 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	PPP3CA	Q08209	521 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	ZACN	Q401N2	412 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	SV2A	Q7L0J3	742 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	GPR149	Q86SP6	731 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	METTL23	Q86XA0	190 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM209	Q96SK2	561 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	HUS1	O60921	280 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	ZMYND10	O75800	440 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	BIRC3	Q13489	604 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	TRPC3	Q13507	836 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	CES5A	Q6NT32	575 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	C8A	P07357	584 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	ATF2	P15336	505 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	PAK1	Q13153	545 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	TPGS2	Q68CL5	300 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	MED15	Q96RN5	788 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	BICDL2	A1A5D9	508 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	SEC24A	O95486	1093 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TTC3-223	ENST00000492275	VNN2	O95498	520 aa		27.71	■■■□□ 2.03

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