RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.2■■□□□ 1.14
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RPUSD3-210ENST00000460909 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF280DQ6N043 979 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD3-210ENST00000460909 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD3-210ENST00000460909 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RPUSD3-210ENST00000460909 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RPUSD3-210ENST00000460909 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD3-210ENST00000460909 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.2■■□□□ 1.14
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RPUSD3-210ENST00000460909 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.2■■□□□ 1.14
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RPUSD3-210ENST00000460909 ROR1Q01973 937 aa22.19■■□□□ 1.14
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RPUSD3-210ENST00000460909 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3-210ENST00000460909 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3-210ENST00000460909 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.19■■□□□ 1.14
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RPUSD3-210ENST00000460909 SUSD6Q92537 303 aa22.19■■□□□ 1.14
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RPUSD3-210ENST00000460909 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3-210ENST00000460909 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3-210ENST00000460909 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3-210ENST00000460909 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.18■■□□□ 1.14
RPUSD3-210ENST00000460909 WDR27A2RRH5 827 aa22.18■■□□□ 1.14
RPUSD3-210ENST00000460909 IL9P15248 144 aa22.18■■□□□ 1.14
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RPUSD3-210ENST00000460909 APOL5Q9BWW9 433 aa22.18■■□□□ 1.14
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RPUSD3-210ENST00000460909 VNN1O95497 513 aa22.17■■□□□ 1.14
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RPUSD3-210ENST00000460909 PAK1Q13153 545 aa22.17■■□□□ 1.14
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RPUSD3-210ENST00000460909 MED15Q96RN5 788 aa22.17■■□□□ 1.14
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RPUSD3-210ENST00000460909 OR4Q2P0C623 313 aa22.14■■□□□ 1.13
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RPUSD3-210ENST00000460909 ATICP31939 592 aa22.14■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 GCLMP48507 274 aa22.14■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 BIRC3Q13489 604 aa22.14■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 TRPC3Q13507 836 aa22.14■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 NCOA4Q13772 614 aa22.14■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.14■■□□□ 1.13
RPUSD3-210ENST00000460909 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.14■■□□□ 1.13
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