RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 VPS54Q9P1Q0 977 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 BTBD18B2RXH4 712 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 CBFA2T2O43439 604 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 LPXNO60711 386 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 CUTAO60888 179 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 PDHBP11177 359 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 PFKLP17858 780 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 PTPAQ15257 358 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 NPY5RQ15761 445 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 VWA3BQ502W6 1294 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 WDR78Q5VTH9 848 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 FIBCD1Q8N539 461 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 FSIP1Q8NA03 581 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 DCAF4Q8WV16 495 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 FUCA2Q9BTY2 467 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 BARHL2Q9NY43 387 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 NYAP2Q9P242 653 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 KCNJ14Q9UNX9 436 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 CLIC4Q9Y696 253 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 SPTBN2O15020 2390 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 COL4A6Q14031 1691 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 UMODL1Q5DID0 1318 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 ZNF292O60281 2723 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 KLRF2D3W0D1 207 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 STXBP3O00186 592 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 CA3P07451 260 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 CMA1P23946 247 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 CYP2C18P33260 490 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 BACE1P56817 501 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 NLRP5P59047 1200 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 NFKB2Q00653 900 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 ICA1Q05084 483 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 ZNF543Q08ER8 600 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 JAMLQ86YT9 394 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 TIGD1Q96MW7 591 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 RIOX1Q9H6W3 641 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 IL23AQ9NPF7 189 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 BTBD7Q9P203 1132 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 HPSEQ9Y251 543 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 CYTH3O43739 400 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 CELA3BP08861 270 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 ITGA4P13612 1032 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 IFNGR1P15260 489 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 PFKFB1P16118 471 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 GNA11P29992 359 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 LIMS1P48059 325 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 GRB10Q13322 594 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 STX1AQ16623 288 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 TTC38Q5R3I4 469 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 RESP18Q5W5W9 173 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 BLIDQ8IZY5 108 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 MKL1Q969V6 931 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 CCDC34Q96HJ3 373 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 ZMYND12Q9H0C1 365 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 RNF38Q9H0F5 515 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 SH2D4AQ9H788 454 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-202ENST00000409189 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms