RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CopeO89079 308 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cav1P49817 178 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fdft1P53798 416 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lzts1P60853 599 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Col6a1Q04857 1025 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ZufspQ3T9Z9 577 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Orai2Q8BH10 250 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Spire2Q8K1S6 718 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc25a19Q9DAM5 318 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rad18Q9QXK2 509 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Phf11A6H5X4 337 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc175E9PVB3 822 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Btaf1E9QAE3 1848 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cdk2ap1O35207 114 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 HdcP23738 662 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PpargP37238 505 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Psmc6P62334 389 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adcy8P97490 1249 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Qrich1Q3UA37 777 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Stxbp3Q60770 592 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SpopQ6ZWS8 374 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr449Q8VGW8 311 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Josd2Q9CR30 188 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Myh14Q6URW6 2000 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Galntl6E5D8G1 601 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hcn4O70507 1186 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rrm1P07742 792 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atf2P16951 487 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 DselQ0VBN2 1207 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam91a1Q3UVG3 837 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vmn1r209Q5NC97 312 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Birc2Q62210 612 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 GnasQ6R0H7 1133 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Snap47Q8R570 413 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Uroc1Q8VC12 676 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atp6v1b1Q91YH6 513 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ivns1abpQ920Q8 642 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dusp21Q9D9D8 189 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf354bQ9QXT9 601 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PygmQ9WUB3 842 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fitm2P59266 262 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sh2d5Q8JZW5 429 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Med21Q9CQ39 144 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Polr3cQ9D483 533 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PpihQ9D868 188 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Btbd35f16A0A087WSN2 498 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr1145A2AVC7 325 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ifit3bE9PV48 403 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp266E9Q2S7 604 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc27a2O35488 620 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Stat3P42227 770 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Syt2P46097 422 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cyp2e1Q05421 493 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm8773Q3UQ24 132 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ItgaeQ60677 1167 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc18a1Q8R090 521 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pofut2Q8VHI3 429 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Themis2Q91YX0 663 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dctn2Q99KJ8 402 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Efhc1Q9D9T8 648 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ap2b1Q9DBG3 937 aa18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Klf1P46099 358 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pex2P55098 305 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Epas1P97481 874 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cd300lgQ1ERP8 331 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Marveld2Q3UZP0 555 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Clhc1Q5M6W3 596 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cd248Q91V98 765 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lrp8Q924X6 996 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Chst12Q99LL3 419 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 DcpsQ9DAR7 338 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Myl7Q9QVP4 175 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Prkab1Q9R078 270 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mta2Q9R190 668 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ptpn4Q9WU22 926 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam155bA2BDP1 471 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccnb1P24860 430 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rnf113a2Q14B01 337 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Wdr41Q3UDP0 460 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zcwpw1Q6IR42 630 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tgm6Q8BM11 706 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sntg2Q925E0 539 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lman1Q9D0F3 517 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lrp2bpQ9D4C6 346 aa18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cdk14O35495 469 aa18.15■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adam15O88839 864 aa18.15■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc10a5Q5PT54 434 aa18.15■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgap30Q640N3 1101 aa18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.6 ms