Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
ItgaeQ60677 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ItgaeQ60677 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
ItgaeQ60677 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ItgaeQ60677 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
ItgaeQ60677 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
ItgaeQ60677 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ItgaeQ60677 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ItgaeQ60677 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ItgaeQ60677 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ItgaeQ60677 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ItgaeQ60677 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35■■■■□ 3.19
ItgaeQ60677 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
ItgaeQ60677 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ItgaeQ60677 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ItgaeQ60677 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ItgaeQ60677 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ItgaeQ60677 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ItgaeQ60677 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ItgaeQ60677 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ItgaeQ60677 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ItgaeQ60677 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ItgaeQ60677 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ItgaeQ60677 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ItgaeQ60677 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ItgaeQ60677 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ItgaeQ60677 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ItgaeQ60677 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ItgaeQ60677 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ItgaeQ60677 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ItgaeQ60677 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ItgaeQ60677 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ItgaeQ60677 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ItgaeQ60677 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ItgaeQ60677 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ItgaeQ60677 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ItgaeQ60677 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ItgaeQ60677 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ItgaeQ60677 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
ItgaeQ60677 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ItgaeQ60677 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ItgaeQ60677 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ItgaeQ60677 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ItgaeQ60677 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ItgaeQ60677 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ItgaeQ60677 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ItgaeQ60677 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ItgaeQ60677 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ItgaeQ60677 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ItgaeQ60677 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ItgaeQ60677 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ItgaeQ60677 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ItgaeQ60677 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ItgaeQ60677 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ItgaeQ60677 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ItgaeQ60677 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
ItgaeQ60677 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ItgaeQ60677 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ItgaeQ60677 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ItgaeQ60677 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ItgaeQ60677 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ItgaeQ60677 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ItgaeQ60677 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ItgaeQ60677 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
ItgaeQ60677 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ItgaeQ60677 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
ItgaeQ60677 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ItgaeQ60677 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ItgaeQ60677 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ItgaeQ60677 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ItgaeQ60677 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ItgaeQ60677 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ItgaeQ60677 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ItgaeQ60677 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ItgaeQ60677 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ItgaeQ60677 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ItgaeQ60677 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ItgaeQ60677 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ItgaeQ60677 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ItgaeQ60677 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ItgaeQ60677 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ItgaeQ60677 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ItgaeQ60677 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ItgaeQ60677 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ItgaeQ60677 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ItgaeQ60677 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ItgaeQ60677 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ItgaeQ60677 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ItgaeQ60677 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ItgaeQ60677 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ItgaeQ60677 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ItgaeQ60677 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ItgaeQ60677 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ItgaeQ60677 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ItgaeQ60677 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ItgaeQ60677 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ItgaeQ60677 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ItgaeQ60677 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ItgaeQ60677 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ItgaeQ60677 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms