Protein–RNA interactions for Protein: P46097

Syt2, Synaptotagmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt2P46097 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
Syt2P46097 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Syt2P46097 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Syt2P46097 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Syt2P46097 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Syt2P46097 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Syt2P46097 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Syt2P46097 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Syt2P46097 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Syt2P46097 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Syt2P46097 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Syt2P46097 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Syt2P46097 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Syt2P46097 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Syt2P46097 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Syt2P46097 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Syt2P46097 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Syt2P46097 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Syt2P46097 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Syt2P46097 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Syt2P46097 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Syt2P46097 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Syt2P46097 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Syt2P46097 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Syt2P46097 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Syt2P46097 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Syt2P46097 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Syt2P46097 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Syt2P46097 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Syt2P46097 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Syt2P46097 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Syt2P46097 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Syt2P46097 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Syt2P46097 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Syt2P46097 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Syt2P46097 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Syt2P46097 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Syt2P46097 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Syt2P46097 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Syt2P46097 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Syt2P46097 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Syt2P46097 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Syt2P46097 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Syt2P46097 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Syt2P46097 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Syt2P46097 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Syt2P46097 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Syt2P46097 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Syt2P46097 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Syt2P46097 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Syt2P46097 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Syt2P46097 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Syt2P46097 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Syt2P46097 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Syt2P46097 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Syt2P46097 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Syt2P46097 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Syt2P46097 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Syt2P46097 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Syt2P46097 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Syt2P46097 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Syt2P46097 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Syt2P46097 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Syt2P46097 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Syt2P46097 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Syt2P46097 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Syt2P46097 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Syt2P46097 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Syt2P46097 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Syt2P46097 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Syt2P46097 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Syt2P46097 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Syt2P46097 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Syt2P46097 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Syt2P46097 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Syt2P46097 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Syt2P46097 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Syt2P46097 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Syt2P46097 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Syt2P46097 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Syt2P46097 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Syt2P46097 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Syt2P46097 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Syt2P46097 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Syt2P46097 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Syt2P46097 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Syt2P46097 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Syt2P46097 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Syt2P46097 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Syt2P46097 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Syt2P46097 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Syt2P46097 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Syt2P46097 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Syt2P46097 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Syt2P46097 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Syt2P46097 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Syt2P46097 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Syt2P46097 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Syt2P46097 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Syt2P46097 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.2 ms