RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	GCN3	P14741	305 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	COS8	P38723	381 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	BOL3	P39724	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	SSO2	P39926	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YJR012C	P47087	207 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	DAL4	Q04895	635 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	FEX2	Q08991	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	ATO3	Q12359	275 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	ACB1	P31787	87 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YGR210C	P42942	411 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YNL234W	P53857	426 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	VPS28	Q02767	242 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	PAM18	Q07914	168 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YNG1	Q08465	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YCR061W	P25639	631 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	PSD1	P39006	500 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YFH1	Q07540	174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	FEX1	Q08913	375 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YPS3	Q12303	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	SEC22	P22214	214 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	ERV1	P27882	189 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YKL162C	P36052	402 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YKR045C	P36138	183 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	GEP4	P38812	185 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YIR035C	P40579	254 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YFL054C	P43549	646 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YGR050C	P53231	118 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	GPI15	P53961	229 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	PHO85	P17157	305 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	SLM6	P38343	150 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	PRE3	P38624	215 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	SWM2	P40342	146 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YJL213W	P40896	331 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YJL163C	P46996	555 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YJR056C	P47115	236 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YIP1	P53039	248 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	FSH2	Q05015	223 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	SRL1	Q08673	210 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	ATG5	Q12380	294 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	ATG31	Q12421	196 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	COA2	Q3E823	68 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	MRS4	P23500	304 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	DAL3	P32459	195 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	ECM27	P47144	725 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	EST3	Q03096	181 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	HOF1	Q05080	669 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	RAD28	Q12021	506 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	FCY1	Q12178	158 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	PDC2	P32896	925 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YEA6	P39953	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YGR151C	P53287	111 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	HCH1	P53834	153 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	ANT1	Q06497	328 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	RRT7	Q07829	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	RKI1	Q12189	258 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	INO2	P26798	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CIN4	YMR138W	FPR2	P32472	135 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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