RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A TVP23P38962 199 aa-0.24□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A NUP84P52891 726 aa-0.24□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A MRPL50P53724 139 aa-0.24□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A YLR173WQ06247 608 aa-0.24□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A DGA1Q08650 418 aa-0.24□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A ODC2Q99297 307 aa-0.24□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A KSS1P14681 368 aa-0.25□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A URA6P15700 204 aa-0.25□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A ATP15P21306 62 aa-0.25□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.25□□□□□ -2.45not detected
YMR001C-AYMR001C-A YAR064WP39563 99 aa-0.25□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A YFL051CP43552 160 aa-0.25□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A UBC12P52491 188 aa-0.25□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A MPC3P53311 146 aa-0.25□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A PAM18Q07914 168 aa-0.25□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A CDC28P00546 298 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A COX8P04039 78 aa-0.26□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A RPB3P16370 318 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A APS1P35181 156 aa-0.26□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A LIA1P47120 325 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A AIM25P47140 327 aa-0.26□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A MET31Q03081 177 aa-0.26□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A FIT2Q08906 153 aa-0.26□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A PRM3Q08931 133 aa-0.26□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A SEN2P16658 377 aa-0.27□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A YNL134CP53912 376 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A YOL107WQ12239 342 aa-0.27□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A RPO26P20435 155 aa-0.28□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A PTM1P32857 523 aa-0.28□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A AST2P39945 430 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A DCV1P43595 202 aa-0.28□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A FYV6P53913 173 aa-0.28□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A MED4Q12343 284 aa-0.28□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A ATG31Q12421 196 aa-0.28□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A YFR032C-BQ8TGU2 87 aa-0.28□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A POR1P04840 283 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A RMD6P39975 231 aa-0.29□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A BNA6P43619 295 aa-0.29□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A ALB1P47019 175 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A BXI1P48558 297 aa-0.29□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A BRR6P53062 197 aa-0.29□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A YGR050CP53231 118 aa-0.29□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A RRN5Q02983 363 aa-0.29□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A FYV12Q08559 129 aa-0.29□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A YPR013CQ12145 317 aa-0.29□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A PAN3P36102 679 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A GCN20P43535 752 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A GET1P53192 235 aa-0.3□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A THG1P53215 237 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A RNH202Q05635 350 aa-0.3□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A CKS1P20486 150 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A ARO7P32178 256 aa-0.31□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A YJR111CP47148 283 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A FIT1Q04433 528 aa-0.31□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A IRC23Q08416 157 aa-0.31□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A PHO85P17157 305 aa-0.32□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A MAK5P38112 773 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A KAP95Q06142 861 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A TAR1Q8TGM6 124 aa-0.32□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A SEY1Q99287 776 aa-0.32□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A SEC4P07560 215 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A SFK1P35735 353 aa-0.33□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A LDB7P38210 180 aa-0.33□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A VPS71Q03433 280 aa-0.33□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A SSO1P32867 290 aa-0.34□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A RPC17P47076 161 aa-0.34□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A YJR015WP47090 510 aa-0.34□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A MIC26P50087 233 aa-0.34□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A HNT1Q04344 158 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A ABP140Q08641 628 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A YHR214C-EQ8TGK0 99 aa-0.34□□□□□ -2.46
YMR001C-AYMR001C-A MAG1P22134 296 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A COG5P53951 403 aa-0.35□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A YNG1Q08465 219 aa-0.35□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A OCH1P31755 480 aa-0.36□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A COX15P40086 486 aa-0.36□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A NOP19P53317 196 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A SRL4Q03085 281 aa-0.36□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A TMA23Q03525 211 aa-0.36□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A ELP6Q04868 273 aa-0.36□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A GSP2P32836 220 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A ALG13P53178 202 aa-0.37□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A YMR295CQ03559 197 aa-0.37□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A YHR213W-BQ8TGK1 99 aa-0.37□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A YCR090CP25654 182 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A YLR283WQ05867 314 aa-0.38□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A GET4Q12125 312 aa-0.38□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A JLP1Q12358 412 aa-0.38□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A RPL25P04456 142 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A HHY1P39982 102 aa-0.39□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A FMC1P40491 155 aa-0.39□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A LSM7P53905 115 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A PET191Q02772 108 aa-0.39□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A DYN3Q04949 312 aa-0.39□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A PST2Q12335 198 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
YMR001C-AYMR001C-A DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.9 ms