RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	PAU24	P38155	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	COX15	P40086	486 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YGL204C	P53089	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	PEX31	P53203	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	GIS1	Q03833	894 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	TDA6	Q06466	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	LAA1	P39526	2014 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	ATS1	P31386	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
UBX2	YML013W	PPZ2	P33329	710 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YOX1	P34161	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	SRP14	P38985	146 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	MIC26	P50087	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	MET31	Q03081	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	EST3	Q03096	181 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	BSC1	Q12140	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	COX19	Q3E731	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	GSC2	P40989	1895 aa		4.84	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	SAL1	D6W196	494 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	PAU3	P25610	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YPC1	P38298	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	IRC22	P40006	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	TOS2	P50078	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	VEL1	P53058	206 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	PAU12	P53343	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YNR014W	P53719	212 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	BNA5	Q05979	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	COQ10	Q08058	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	ICT1	Q12385	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	PCL9	Q12477	304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	STT4	P37297	1900 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	MET30	P39014	640 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	AVT7	P40501	490 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	JJJ3	P47138	172 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	BNS1	P50084	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	ELP6	Q04868	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	CTR3	Q06686	241 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	IRC10	Q08118	586 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YCT1	Q12235	531 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	NUP1	P20676	1076 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YKL097C	P34245	136 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	MRPS9	P38120	278 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	TRS20	P38334	175 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	TMA23	Q03525	211 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	CCE1	Q03702	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	CNL1	Q06333	122 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	MCH1	Q07376	486 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	RRT7	Q07829	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	PST1	Q12355	444 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	COX5A	P00424	153 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	MIG1	P27705	504 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	PAU2	P32612	120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	RPA43	P46669	326 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YGL262W	P53054	175 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	NIF3	P53081	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	VHT1	P53241	593 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	ADD37	Q03233	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YML018C	Q03730	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	PAU23	Q07987	124 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	ENB1	Q08299	606 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	PAU17	Q12370	124 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	LAS17	Q12446	633 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	MSW1	P04803	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	YCR006C	P25350	157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	UTR5	P32630	166 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	TOA2	P32774	122 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX2	YML013W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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