RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	PGA1	P53896	198 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	SWP1	Q02795	286 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	ARR2	Q06597	130 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	DGA1	Q08650	418 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	MCP1	Q12106	302 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	YPR063C	Q12160	140 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	PSF1	Q12488	208 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	REP2	P03872	296 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	Q0255	P03881	472 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	YCR023C	P25351	611 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	POP7	P38291	140 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	PRM10	P42946	383 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	PET54	P10834	293 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	LDB16	P25587	256 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	FMP23	P38231	175 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	YAP3	P38749	330 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	YER188W	P40103	239 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	APJ1	P53940	528 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	CDC8	P00572	216 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	MED6	P38782	295 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	AIM2	P39721	246 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	YDR476C	Q03362	224 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	SCW10	Q04951	389 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	SAS5	Q99314	248 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	MRPS28	P21771	286 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	UBC8	P28263	218 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	YGR026W	P53217	278 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	TRM12	Q04235	462 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	YOR268C	Q08734	132 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPS0B	YLR048W	NUF2	P33895	451 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	TDA4	P47153	279 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	ECM11	Q04110	302 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	SPO13	P23624	291 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	VMA11	P32842	164 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	SLM6	P38343	150 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YIR035C	P40579	254 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YGL088W	P53151	121 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	TSC3	Q3E790	80 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	TIM9	O74700	87 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	ATP15	P21306	62 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YKR032W	P36127	104 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	AVT2	P39981	480 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	RFC2	P40348	353 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	SER2	P42941	309 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YGL101W	P53144	215 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	AKR2	Q12013	749 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YOR342C	Q12182	319 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	PDR18	P53756	1333 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	CCA1	P21269	546 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	OCH1	P31755	480 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	UPS2	P35200	230 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	MID2	P36027	376 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	CTR2	P38865	189 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YIL059C	P40520	121 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	DSK2	P48510	373 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YGR042W	P53227	271 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YLR046C	Q12253	270 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YEA4	P40004	342 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	SNX4	P47057	423 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YOL014W	Q08110	124 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	IES4	Q08561	116 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YPR202W	Q08993	238 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YDL180W	Q12301	547 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	MRPL17	P36528	281 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	OPY1	P38271	328 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	MNN5	P46982	586 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	PIR5	P46999	287 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	XPT1	P47165	209 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	SOL1	P50278	321 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YGL204C	P53089	101 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YDR114C	Q04597	100 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	DGK1	Q12382	290 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPS0B	YLR048W	MSW1	P04803	379 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	PEX34	P25584	144 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	NSG1	P38837	291 aa		3.4	□□□□□ -1.87

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