RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	5.1	□□□□□ -1.59	not detected
GPT2	YKR067W	YIR035C	P40579	254 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	CHA4	P43634	648 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	MRH4	P53166	561 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	YPL068C	Q02749	293 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	YDR209C	Q03480	137 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	TDA1	Q03533	586 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	YPR063C	Q12160	140 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	STE7	P06784	515 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	RPL12B	P0CX54	165 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	DCG1	P32460	244 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	MSN2	P33748	704 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	ECM15	P35195	104 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	PAM16	P42949	149 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	ATG27	P46989	271 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	AVT4	P50944	713 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	HHT1	P61830	136 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	RHO4	Q00246	291 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	FEX1	Q08913	375 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	YCR100C	P25606	316 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	YBR096W	P38256	230 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	ECM14	P38836	430 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	YNL195C	P40168	261 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	XPT1	P47165	209 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	DIE2	P50076	525 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	TOS2	P50078	622 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	PDR17	P53844	350 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	NUP53	Q03790	475 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	ASM4	Q05166	528 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	YDL177C	Q12257	170 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GPT2	YKR067W	MSB2	P32334	1306 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	SFC1	P33303	322 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	SNC2	P33328	115 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	MRPS5	P33759	307 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	YEA6	P39953	335 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	NSE4	P43124	402 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	SDT1	P53078	280 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	YOL024W	Q08172	172 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	MET32	Q12041	191 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	TFS1	P14306	219 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	STF2	P16965	84 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	POF1	P25576	258 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	CPR3	P25719	182 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	DOG1	P38774	246 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	LIP2	Q06005	328 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	REP2	P03872	296 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	STP22	P25604	385 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	QRI5	P32344	111 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	SNM1	P40993	198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	TRM9	P49957	279 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	TMA10	Q06177	86 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	HEM25	Q07534	307 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	SOR2	Q07786	357 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	OPI3	P05375	206 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	MRS1	P07266	363 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	TRR2	P38816	342 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	MDM31	P38880	579 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	EGT2	P42835	1041 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	MTM1	P53320	366 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	MRX11	Q03079	207 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	ELP6	Q04868	273 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	MRX8	Q05473	314 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
GPT2	YKR067W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	ECM34	P38728	170 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	PEX22	P39718	180 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	ELC1	Q03071	99 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	YLR030W	Q07967	263 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	MMT2	Q08970	484 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	SPC3	Q12133	184 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	YLR118C	Q12354	227 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	PPH21	P23594	369 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	LDS1	P31379	325 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GPT2	YKR067W	PEX7	P39108	375 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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