RNA–Protein interactions for RNA: YKL215C

OXP1, Transcript of 5-oxoprolinase, yeast

Gene OXP1, Length 3,861 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OXP1	YKL215C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SIR2	P06700	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SPT23	P35210	1082 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	CBP4	P37267	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	MIC12	P38341	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	CAT5	P41735	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	ATG27	P46989	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	BSP1	Q06604	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	MCT1	Q12283	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	RIP1	P08067	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YCR007C	P25354	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YNL194C	P40169	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	EMC5	P40540	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	ATG41	Q12048	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	CTA1	P15202	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YHL026C	P38740	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YAL037W	P39728	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YNL198C	P40166	100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	PHS1	P40857	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	DAD3	P69850	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YPR114W	Q06107	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	RTC2	P38279	296 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	AZF1	P41696	914 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YFL054C	P43549	646 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	ALG13	P53178	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	HHT1	P61830	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SWT1	Q12104	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	NTH1	P32356	751 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	TRR2	P38816	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	AIM25	P47140	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	TIS11	P47977	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	PLB3	Q08108	686 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	UBC5	P15732	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	CPT1	P17898	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	HXT4	P32467	576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	PAU5	P43575	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	VPS25	P47142	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SNO4	Q04902	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	HSP32	Q08992	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	PFA4	Q12006	378 aa		4.84	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	RDI1	Q12434	202 aa		4.84	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	MSI1	P13712	422 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	CTF8	P38877	133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	ERG25	P53045	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	TYW3	P53177	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	YNL143C	P53908	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	DCI1	Q08558	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	FRE7	Q12333	620 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	SWM1	Q12379	170 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	CDC21	P06785	304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	MSY1	P48527	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	YDL186W	P48568	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	YIP1	P53039	248 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	YHR210C	P38893	341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	PIR3	Q03180	325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.82	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.82	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	PAU16	P35994	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	IRC22	P40006	225 aa		4.82	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	TSA2	Q04120	196 aa		4.82	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.82	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	MET31	Q03081	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	OPI10	Q08202	246 aa		4.82	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	LDS2	Q08218	356 aa		4.82	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.82	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	COX1	P00401	534 aa		4.81	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	FUB1	P25659	250 aa		4.81	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	UBP8	P50102	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	NFS1	P25374	497 aa		4.81	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	VMA3	P25515	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
OXP1	YKL215C	NNK1	P36003	928 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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