RNA–Protein interactions for RNA: YJR104C

SOD1, Transcript of Cytosolic copper-zinc superoxide dismutase, yeast

Gene SOD1, Length 465 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	YJR104C	VHT1	P53241	593 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	PDR17	P53844	350 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YPL077C	Q02831	240 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	ADD37	Q03233	198 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YMR166C	Q03829	368 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	THI74	Q04083	370 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YPR114W	Q06107	315 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	TAZ1	Q06510	381 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	RXT3	Q07458	294 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YLR036C	Q07986	203 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	BSC1	Q12140	328 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	RKI1	Q12189	258 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	FRE8	Q12209	686 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	ERV2	Q12284	196 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YDR262W	Q12331	272 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	IZH2	Q12442	317 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	CNE1	P27825	502 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	PPA2	P28239	310 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	PAU16	P35994	123 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	GEX2	P36173	615 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	THI2	P38141	450 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YEA6	P39953	335 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	NAS2	P40555	220 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	PET130	P47065	347 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	BNA2	P47125	453 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YJR120W	P47157	116 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	RNH201	P53942	307 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	EFM6	P53970	246 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	ATG21	Q02887	496 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	CCE1	Q03702	353 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	ARA2	Q04212	335 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	SDH7	Q04401	133 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	HLR1	Q04429	423 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YMR252C	Q04814	134 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	SCW10	Q04951	389 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	STP3	Q05937	343 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YDL218W	Q07629	317 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	RRT7	Q07829	113 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YDL157C	Q12082	118 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YDL177C	Q12257	170 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	ICT1	Q12385	394 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	RAX2	Q12465	1220 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	SOD2	P00447	233 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	COX9	P07255	59 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	GPI12	P23797	304 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YCR023C	P25351	611 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	MIG1	P27705	504 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	DCG1	P32460	244 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	SRB5	P32585	307 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	PPZ2	P33329	710 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	SGE1	P33335	543 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	UPS2	P35200	230 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	THI80	P35202	319 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	TAE1	P38340	232 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YBR292C	P38357	123 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	SDP1	P40479	209 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	ATG27	P46989	271 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YJL163C	P46996	555 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YJR015W	P47090	510 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	XPT1	P47165	209 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	TTI2	P47168	421 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	MSY1	P48527	492 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	COX18	P53239	316 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	MTM1	P53320	366 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	APS2	Q00381	147 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	ASM4	Q05166	528 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	NDD1	Q08887	554 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	LAS17	Q12446	633 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	YOR338W	Q99326	363 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SOD1	YJR104C	CHO1	P08456	276 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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