RNA–Protein interactions for RNA: YDR107C

TMN2, Transcript of Protein with a role in cellular adhesion and filamentous growth, yeast

Gene TMN2, Length 2,019 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMN2	YDR107C	YLR030W	Q07967	263 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	YLR036C	Q07986	203 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	SEC22	P22214	214 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	MSA2	P36157	363 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	YIL054W	P40524	105 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	YPI1	P43587	155 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	RPA43	P46669	326 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	PRM8	P53174	237 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	YGR050C	P53231	118 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	YPL247C	Q12523	523 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	MGT1	P26188	188 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	PTM1	P32857	523 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	CAX4	P53223	239 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	YDL211C	Q12121	372 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	ILM1	P47155	203 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	MDM34	P53083	459 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	ABF2	Q02486	183 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	MRPS16	Q02608	121 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	TVP15	Q03860	143 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	NSL1	Q12143	216 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	CDC7	P06243	507 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	IRC22	P40006	225 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	ICE2	P40499	491 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	FLC3	P53121	802 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	MDM32	Q12171	622 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	CCH1	P50077	2039 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	CDC8	P00572	216 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	EAF6	P47128	113 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	MIG2	P53035	382 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	DID2	P69771	204 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	DAS2	Q12084	232 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	NVJ1	P38881	321 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	TEM1	P38987	245 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	UFE1	P41834	346 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	HST4	P53688	370 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	RDI1	Q12434	202 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMN2	YDR107C	YLR462W	O13556	202 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	ECM34	P38728	170 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	DOG2	P38773	246 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	YEL075C	P39972	122 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	COQ5	P49017	307 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	SBH2	P52871	88 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	COG5	P53951	403 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	YDR278C	Q05612	105 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	SIR2	P06700	562 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	UBC8	P28263	218 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	YLR053C	Q12026	108 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	SFC1	P33303	322 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	BDH1	P39714	382 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	HSK3	P69852	69 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	LPP1	Q04396	274 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	SLD7	Q08457	257 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	DSF1	P0CX08	502 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	YNR073C	P0CX09	502 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	CNB1	P25296	175 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	YCR023C	P25351	611 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
TMN2	YDR107C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	GAS3	Q03655	524 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	YPR127W	Q06494	345 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	RMD6	P39975	231 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	YML108W	Q03759	105 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	SPC2	Q04969	178 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	YPL264C	Q08980	353 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	PRR2	Q12310	699 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	PST1	Q12355	444 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	PEX11	Q12462	236 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	FCY2	P17064	533 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	AHC2	P25649	128 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TMN2	YDR107C	TRR2	P38816	342 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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