RNA–Protein interactions for RNA: YBL058W

SHP1, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene SHP1, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHP1	YBL058W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YIL060W	P40519	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	ILM1	P47155	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	SOL1	P50278	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	TOS8	P53147	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	NDE2	Q07500	545 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	ODC2	Q99297	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	HIS3	P06633	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	PET54	P10834	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	LSB5	P25369	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	MRP20	P32387	263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YKR045C	P36138	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	IKI1	P38874	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	RFC2	P40348	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	ECM27	P47144	725 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	DIE2	P50076	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	LPP1	Q04396	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	MSC3	Q05812	728 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YUH1	P35127	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	PCL7	P40186	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	IRC24	P40580	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YGR042W	P53227	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	TSA2	Q04120	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	SCW10	Q04951	389 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	ASM4	Q05166	528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	GAL1	P04385	528 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	AAC1	P04710	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	URA6	P15700	204 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	HYM1	P32464	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	MPC2	P38857	129 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	GET2	P40056	285 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YNL194C	P40169	301 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YJL163C	P46996	555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	VHT1	P53241	593 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	NRG1	Q03125	231 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	ATG41	Q12048	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHP1	YBL058W	URA3	P03962	267 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	CHO1	P08456	276 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	YMR31	P19955	123 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	ERV1	P27882	189 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	GEP4	P38812	185 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	PCL6	P40038	420 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	OTU1	P43558	301 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	TDA1	Q03533	586 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	YLR415C	O13578	112 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	CKA1	P15790	372 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	SEN2	P16658	377 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	ROX3	P25046	220 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	FCY21	P40039	528 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	RTT105	P40063	208 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	COX15	P40086	486 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	UBP8	P50102	471 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	CRH1	P53301	507 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	YDR274C	P87283	123 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	RCF1	Q03713	159 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	GRX3	Q03835	250 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	GPN3	Q06543	272 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	YFH1	Q07540	174 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	IRC23	Q08416	157 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	YPS1	P32329	569 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	YJR012C	P47087	207 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	YGR219W	P53307	113 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	CAB5	Q03941	241 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	RKI1	Q12189	258 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	INP53	Q12271	1107 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	CDC23	P16522	626 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	PDC2	P32896	925 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	RIB7	P33312	244 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SHP1	YBL058W	SEC66	P33754	206 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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