RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	ASAH2	Q9NR71	780 aa		13.37	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	PTPRB	P23467	1997 aa		13.37	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	CIT	O14578	2027 aa		13.37	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		13.37	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	OBSL1	O75147	1896 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	ANK1	P16157	1881 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	ANTXRL	A6NF34	631 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	RNF40	O75150	1001 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	PRB1	P04280	392 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	SCAP	Q12770	1279 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	EPHA7	Q15375	998 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	ELF2	Q15723	593 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	GAREM2	Q75VX8	874 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	TPH2	Q8IWU9	490 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	FZD8	Q9H461	694 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	HPS4	Q9NQG7	708 aa		13.36	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	NID2	Q14112	1375 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	SLITRK3	O94933	977 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	RCAN1	P53805	252 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	NLRP5	P59047	1200 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	PMS2CL	Q68D20	193 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	PIP4P1	Q86T03	277 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	CRELD1	Q96HD1	420 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	AIFM3	Q96NN9	605 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	RHOBTB1	O94844	696 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	OR4Q2	P0C623	313 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	GBP1	P32455	592 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	CEP120	Q8N960	986 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
NUP62-216	ENST00000599560	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	N4BP3	O15049	544 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	DGAT1	O75907	488 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	SOAT2	O75908	522 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	MAPK8	P45983	427 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	TPGS2	Q68CL5	300 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	POTED	Q86YR6	584 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	PODXL	O00592	558 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	C1QL1	O75973	258 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	SEC24B	O95487	1268 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ARSA	P15289	507 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	LIG1	P18858	919 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	RARRES1	P49788	294 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	CDR1	P51861	262 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	CYP4F8	P98187	520 aa		13.32	□□□□□ -0.28

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