RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688		I3L4J1	428 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ARNTL	O00327	626 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	HR	O43593	1189 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	FGF19	O95750	216 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MCF2	P10911	925 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MYL4	P12829	197 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CCR2	P41597	374 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	LIMK1	P53667	647 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SATB1	Q01826	763 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	LPAL2	Q16609	132 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	IL31	Q6EBC2	164 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TCHP	Q9BT92	498 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	OBP2A	Q9NY56	170 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CEP72	Q9P209	647 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CNTN3	Q9P232	1028 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CLIC4	Q9Y696	253 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CCDC169	A6NNP5	214 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MOSPD3	O75425	235 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	OAZ2	O95190	189 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SEC24A	O95486	1093 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	EDN1	P05305	212 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	OR52Z1	P0C646	297 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CPB1	P15086	417 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PDC	P20941	246 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PAX3	P23760	479 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MCM4	P33991	863 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	VIPR2	P41587	438 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ALDH1A3	P47895	512 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	FNTB	P49356	437 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	EPHB3	P54753	998 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SHC2	P98077	582 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	GRIN1	Q05586	938 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	DMWD	Q09019	674 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TWF1	Q12792	350 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PTPA	Q15257	358 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TEAD2	Q15562	447 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CEP68	Q76N32	757 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	BEST2	Q8NFU1	509 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	DDX12P	Q92771	950 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	DRC1	Q96MC2	740 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CDT1	Q9H211	546 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	USP20	Q9Y2K6	914 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ASB3	Q9Y575	518 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	OR6C75	A6NL08	312 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688		K7ESF4	209 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688		M0QZQ0	153 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DPYSL4	O14531	572 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ATG13	O75143	517 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TOM1L1	O75674	476 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	F13A1	P00488	732 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZNF806	P0C7X5	589 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CYP3A5	P20815	502 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PROZ	P22891	400 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PML	P29590	882 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	WEE1	P30291	646 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CDC25A	P30304	524 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	NPTX2	P47972	431 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TRAPPC10	P48553	1259 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PEX3	P56589	373 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	OSTN	P61366	133 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GPR17	Q13304	367 aa		7.46	□□□□□ -1.22

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