RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	PCSK1	P29120	753 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CSF2RB	P32927	897 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CHKA	P35790	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNQ1	P51787	676 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	DAG1	Q14118	895 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF480	Q8WV37	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	LMF1	Q96S06	567 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	F2RL2	O00254	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	IL18RAP	O95256	599 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	AHSG	P02765	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	BRAF	P15056	766 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	DDC	P20711	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	FPR1	P21462	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PRDX5	P30044	214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	RENBP	P51606	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PER3	P56645	1201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	MTM1	Q13496	603 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR32	O75388	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ITGA10	O75578	1167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	HDC	P19113	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	POLD1	P28340	1107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	GRK6	P43250	576 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ETV4	P43268	484 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	FLT3LG	P49771	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ARFIP2	P53365	341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CTXN1	P60606	82 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAM15	Q13444	863 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXE3	Q13461	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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