RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467065.1

UBXN4-205, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN4, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-205ENST00000467065 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 PTGESO14684 152 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 TEX28O15482 410 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 LILRB3O75022 631 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 PHACTR2O75167 634 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 EFEMP2O95967 443 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 MCF2P10911 925 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 GARTP22102 1010 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 KLRC2P26717 231 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF165P49910 485 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 NCKAP1LP55160 1127 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ITIH3Q06033 890 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 TYRO3Q06418 890 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 SPAG1Q07617 926 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 MYBPC2Q14324 1141 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 CES5AQ6NT32 575 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ZBTB33Q86T24 672 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 CD302Q8IX05 232 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 CEP120Q8N960 986 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 XXYLT1Q8NBI6 393 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 NELFBQ8WX92 580 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 FBXL18Q96ME1 805 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ACAP3Q96P50 834 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 CDT1Q9H211 546 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 SCN1AP35498 2009 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 FRMD3A2A2Y4 597 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 KIF4AO95239 1232 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 IL18RAPO95256 599 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 SERPINC1P01008 464 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 THP07101 528 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ADH1AP07327 375 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 TPM1P09493 284 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 CLTAP09496 248 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 SPATA31D3P0C874 917 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 TNNI1P19237 187 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 NR2F2P24468 414 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 CCNE1P24864 410 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 CASP1P29466 404 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 PRCPP42785 496 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 MTHFRP42898 656 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 CYP2J2P51589 502 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 AP3M2P53677 418 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 OSTNP61366 133 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 DSG1Q02413 1049 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 STK4Q13043 487 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 TUSC3Q13454 348 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 MORC3Q14149 939 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 NAB2Q15742 525 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 RTP2Q5QGT7 225 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 RDH13Q8NBN7 331 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 EDAQ92838 391 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 NECTIN4Q96NY8 510 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 TSPAN18Q96SJ8 248 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN4-205ENST00000467065 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms