RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 SPATA20Q8TB22 786 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 SENP8Q96LD8 212 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF560Q96MR9 790 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 MTMR12Q9C0I1 747 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 S1PR5Q9H228 398 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 SFXN1Q9H9B4 322 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 DMAC2Q9NW81 257 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 ITGA11Q9UKX5 1188 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 CDY1Q9Y6F8 540 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 ODC1P11926 461 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 RBP5P82980 135 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 SV2CQ496J9 727 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 CEP135Q66GS9 1140 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF280DQ6N043 979 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 C1orf127Q8N9H9 656 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 HDAC7Q8WUI4 952 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 MFSD14AQ96MC6 490 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 SCN1AP35498 2009 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 ADAM12O43184 909 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 TYMPP19971 482 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 PRCPP42785 496 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 ARPP19P56211 112 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 STIM1Q13586 685 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 RAB33AQ14088 237 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 ISM2Q6H9L7 571 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 LILRA6Q6PI73 481 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 TMC5Q6UXY8 1006 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 CGRRF1Q99675 332 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 PLXNA3P51805 1871 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 KPNA7A9QM74 516 aa23.1■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 CYB561D2O14569 222 aa23.1■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 SPTLC1O15269 473 aa23.1■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 NR2F2P24468 414 aa23.1■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 NFIL3Q16649 462 aa23.1■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 ATAT1Q5SQI0 421 aa23.1■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 METTL23Q86XA0 190 aa23.1■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 OR5B17Q8NGF7 314 aa23.1■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 FAM84AQ96KN4 292 aa23.1■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 RIPOR3Q96MK2 946 aa23.1■■□□□ 1.29
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ABCD4-202ENST00000460308 DSEQ9UL01 958 aa23.1■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.09■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 OAZ2O95190 189 aa23.09■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 MTHFRP42898 656 aa23.09■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 MYO1EQ12965 1108 aa23.09■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 ADAM9Q13443 819 aa23.09■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 LIN9Q5TKA1 542 aa23.09■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.09■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 LRRC52Q8N7C0 313 aa23.09■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 NECTIN4Q96NY8 510 aa23.09■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 TSG101Q99816 390 aa23.09■■□□□ 1.29
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ABCD4-202ENST00000460308 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.09■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 PTPRJQ12913 1337 aa23.08■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa23.08■■□□□ 1.29
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ABCD4-202ENST00000460308 PPP1R2P41236 205 aa23.08■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 CASP4P49662 377 aa23.08■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 BFSP1Q12934 665 aa23.08■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
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ABCD4-202ENST00000460308 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.08■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa23.08■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 SUSD6Q92537 303 aa23.08■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 SIX4Q9UIU6 781 aa23.08■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.08■■□□□ 1.29
ABCD4-202ENST00000460308 DLL1O00548 723 aa23.07■■□□□ 1.28
ABCD4-202ENST00000460308 TBC1D4O60343 1298 aa23.07■■□□□ 1.28
ABCD4-202ENST00000460308 PHACTR2O75167 634 aa23.07■■□□□ 1.28
ABCD4-202ENST00000460308 CPB1P15086 417 aa23.07■■□□□ 1.28
ABCD4-202ENST00000460308 AP3M2P53677 418 aa23.07■■□□□ 1.28
ABCD4-202ENST00000460308 ROR1Q01973 937 aa23.07■■□□□ 1.28
ABCD4-202ENST00000460308 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.07■■□□□ 1.28
ABCD4-202ENST00000460308 ADHFE1Q8IWW8 467 aa23.07■■□□□ 1.28
ABCD4-202ENST00000460308 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.07■■□□□ 1.28
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