RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 MSRAQ9UJ68 235 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 CLSTN1O94985 981 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 TAF6P49848 677 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 LILRA4P59901 499 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 MYO1EQ12965 1108 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 RAB30Q15771 203 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 EXOC3L4Q17RC7 722 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 CD300LGQ6UXG3 332 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 LMO3Q8TAP4 145 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 MARCH5Q9NX47 278 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 NUB1Q9Y5A7 615 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa31.77■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 SPTLC1O15269 473 aa31.77■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 ASS1P00966 412 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 ATICP31939 592 aa31.77■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF699Q32M78 642 aa31.77■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 EHBP1Q8NDI1 1231 aa31.77■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 IMPG2Q9BZV3 1241 aa31.77■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa31.77■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP31.77■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PPC1 479 aa31.76■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 SLC9A1P19634 815 aa31.76■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 KCNMA1Q12791 1236 aa31.76■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 SV2CQ496J9 727 aa31.76■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 SPOPLQ6IQ16 392 aa31.76■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 ERGIC2Q96RQ1 377 aa31.76■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 ADAM28Q9UKQ2 775 aa31.76■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 TADA2AO75478 443 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM14Q14142 442 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 PTPN21Q16825 1174 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 SLC39A11Q8N1S5 342 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 TAF4BQ92750 862 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 CARNS1A5YM72 827 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 KPNA7A9QM74 516 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 STAU1O95793 577 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 PON1P27169 355 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 NOP14P78316 857 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 WDR72Q3MJ13 1102 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 WDR44Q5JSH3 913 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM65Q6PJ69 517 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 SPRED2Q7Z698 418 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC8AQ8IWT6 810 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 IGSF21Q96ID5 467 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 VRTNQ9H8Y1 702 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP31.75■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 BRCC3P46736 316 aa31.74■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 LRMPQ12912 555 aa31.74■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 SYCP1Q15431 976 aa31.74■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 C17orf80Q9BSJ5 609 aa31.74■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 SPG21Q9NZD8 308 aa31.74■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 RWDD3Q9Y3V2 267 aa31.74■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 CHD9Q3L8U1 2897 aa31.73■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 I3L4J1 428 aa31.73■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 CTNNB1P35222 781 aa31.73■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 BMPR1AP36894 532 aa31.73■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 TAP1Q03518 808 aa31.73■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 TIGD5Q53EQ6 642 aa31.73■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF667Q5HYK9 610 aa31.73■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 ZSCAN30Q86W11 494 aa31.73■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJB2P25686 324 aa31.72■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 PPM1AP35813 382 aa31.72■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 KLK7P49862 253 aa31.72■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 IQCDQ96DY2 449 aa31.72■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 MTUS1Q9ULD2 1270 aa31.72■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 SIK3Q9Y2K2 1263 aa31.72■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 SNX9Q9Y5X1 595 aa31.72■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 APBA1Q02410 837 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 DSTYKQ6XUX3 929 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 TATDN2Q93075 761 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM169Q96HH4 297 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 NT5C1BQ96P26 610 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 KCNF1Q9H3M0 494 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 GDAP2Q9NXN4 497 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 POLIQ9UNA4 740 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 PAX3P23760 479 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 LRIT3Q3SXY7 679 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 PPP2R2DQ66LE6 453 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 FUT10Q6P4F1 479 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 PPFIBP1Q86W92 1011 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 SENP8Q96LD8 212 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 NUP58Q9BVL2 599 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 GPR62Q9BZJ7 368 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 SLC28A3Q9HAS3 691 aa31.71■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa31.7■■■□□ 2.67
ECHS1-201ENST00000368547 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP31.7■■■□□ 2.673e-11■■■■■ 85.9
ECHS1-201ENST00000368547 TRAPPC3O43617 180 aa31.7■■■□□ 2.66
ECHS1-201ENST00000368547 TPM1P09493 284 aa31.7■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms