RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adam23Q9R1V7 829 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tnfrsf11aO35305 625 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Alox12eP55249 662 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Frg1P97376 258 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Brip1Q5SXJ3 1174 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 IarsQ8BU30 1262 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 OlahQ8R197 265 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ces1Q8VCC2 565 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lmcd1Q8VEE1 365 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NwcQ9CQI4 244 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hebp1Q9R257 190 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Osbpl7A2A716 963 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Aff2O55112 1272 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AurkbO70126 345 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PtprcP06800 1291 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 P2rx3Q3UR32 397 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Scnn1aQ61180 699 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PigsQ6PD26 555 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Magea3Q6T340 320 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmc4Q7TQ65 694 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kcng4Q80XM3 506 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NrcamQ810U4 1256 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 IrgcQ8C262 412 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CenpuQ8C4M7 410 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc113Q8C5T8 377 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ces1fQ91WU0 561 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sec16bQ91XT4 1051 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Snf8Q9CZ28 258 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ecel1Q9JMI0 775 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Col1a1P11087 1453 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Skor2A7M7C7 1008 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 JrklB2RRL2 523 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm44503E9PYU5 387 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 EsrraO08580 422 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Art2bO35975 289 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc1a1P51906 523 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sh3rf1Q69ZI1 892 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ntrk3Q6VNS1 825 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Snrnp27Q8K194 155 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rfc4Q99J62 364 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 MtrexQ9CZU3 1040 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fthl17aQ9DAX0 182 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm13941A2AJ38 245 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Elk4P41158 430 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lrfn1Q2WF71 766 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Usp1Q8BJQ2 784 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Armc6Q8BNU0 468 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trmt13Q8BYH3 481 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cdan1Q8CC12 1239 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nsmce3Q9CPR8 279 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 TarsQ9D0R2 722 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Clec4aQ9QZ15 238 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm8298J3QPI0 401 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Psmc2P46471 433 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AcadsQ07417 412 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam172aQ3TNH5 417 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ogfod1Q3U0K8 545 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Prr18Q6PAN7 307 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Morc4Q8BMD7 928 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 BsndQ8VIM4 307 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmem79Q9D709 391 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf287Q9EQB9 759 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Capn12Q9ER56 720 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ptgdr2Q9Z2J6 382 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Astn1Q61137 1302 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abcb11Q9QY30 1321 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 UtrnE9Q6R7 3430 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mia3Q8BI84 1930 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp984A2A7A2 547 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tspyl1O88852 379 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gsta1P13745 223 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Grm2Q14BI2 872 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ankmy2Q3TPE9 440 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atp13a4Q5XF90 1193 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Foxd4Q60688 444 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gsta1Q6P8Q0 223 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cfap206Q6PE87 622 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dnajc6Q80TZ3 938 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fads6Q80UG1 342 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SucoQ8C341 1250 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rpap2Q8VC34 614 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ropn1Q9ESG2 212 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NbnQ9R207 751 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 1700122O11RikJ3QPW6 241 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Als2clQ60I26 952 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Stoml1Q8CI66 399 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc35b4Q8CIA5 331 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Basp1Q91XV3 226 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mms19Q9D071 1031 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Leng1Q9DB98 261 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rnf25Q9QZR0 456 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.9 ms