Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI66

Stoml1, Stomatin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stoml1Q8CI66 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,68■■■■■ 4,26
Stoml1Q8CI66 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Stoml1Q8CI66 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Stoml1Q8CI66 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Stoml1Q8CI66 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,73■■■■□ 3,47
Stoml1Q8CI66 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Stoml1Q8CI66 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,94■■■■□ 3,34
Stoml1Q8CI66 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Stoml1Q8CI66 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,9■■■■□ 3,34
Stoml1Q8CI66 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Stoml1Q8CI66 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Stoml1Q8CI66 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Stoml1Q8CI66 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,92■■■■□ 3,18
Stoml1Q8CI66 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Stoml1Q8CI66 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Stoml1Q8CI66 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
Stoml1Q8CI66 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Stoml1Q8CI66 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Stoml1Q8CI66 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Stoml1Q8CI66 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,19■■■■□ 3,06
Stoml1Q8CI66 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Stoml1Q8CI66 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Stoml1Q8CI66 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Stoml1Q8CI66 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Stoml1Q8CI66 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Stoml1Q8CI66 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3,01
Stoml1Q8CI66 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,71■■■□□ 2,99
Stoml1Q8CI66 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,71■■■□□ 2,99
Stoml1Q8CI66 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Stoml1Q8CI66 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Stoml1Q8CI66 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,25■■■□□ 2,91
Stoml1Q8CI66 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Stoml1Q8CI66 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Stoml1Q8CI66 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Stoml1Q8CI66 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Stoml1Q8CI66 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Stoml1Q8CI66 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Stoml1Q8CI66 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Stoml1Q8CI66 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Stoml1Q8CI66 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Stoml1Q8CI66 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,79■■■□□ 2,84
Stoml1Q8CI66 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,68■■■□□ 2,82
Stoml1Q8CI66 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Stoml1Q8CI66 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Stoml1Q8CI66 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Stoml1Q8CI66 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Stoml1Q8CI66 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Stoml1Q8CI66 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Stoml1Q8CI66 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Stoml1Q8CI66 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Stoml1Q8CI66 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,24■■■□□ 2,75
Stoml1Q8CI66 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
Stoml1Q8CI66 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Stoml1Q8CI66 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Stoml1Q8CI66 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Stoml1Q8CI66 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,96■■■□□ 2,71
Stoml1Q8CI66 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,96■■■□□ 2,71
Stoml1Q8CI66 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Stoml1Q8CI66 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Stoml1Q8CI66 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Stoml1Q8CI66 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Stoml1Q8CI66 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Stoml1Q8CI66 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Stoml1Q8CI66 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,69
Stoml1Q8CI66 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Stoml1Q8CI66 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Stoml1Q8CI66 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Stoml1Q8CI66 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Stoml1Q8CI66 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Stoml1Q8CI66 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Stoml1Q8CI66 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Stoml1Q8CI66 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Stoml1Q8CI66 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Stoml1Q8CI66 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,5■■■□□ 2,63
Stoml1Q8CI66 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,49■■■□□ 2,63
Stoml1Q8CI66 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Stoml1Q8CI66 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Stoml1Q8CI66 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Stoml1Q8CI66 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Stoml1Q8CI66 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Stoml1Q8CI66 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,36■■■□□ 2,61
Stoml1Q8CI66 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,35■■■□□ 2,61
Stoml1Q8CI66 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Stoml1Q8CI66 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Stoml1Q8CI66 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Stoml1Q8CI66 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Stoml1Q8CI66 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Stoml1Q8CI66 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Stoml1Q8CI66 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Stoml1Q8CI66 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Stoml1Q8CI66 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Stoml1Q8CI66 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Stoml1Q8CI66 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Stoml1Q8CI66 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Stoml1Q8CI66 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Stoml1Q8CI66 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Stoml1Q8CI66 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Stoml1Q8CI66 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Stoml1Q8CI66 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Stoml1Q8CI66 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,2 ms