Protein–RNA interactions for Protein: Q61137

Astn1, Astrotactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn1Q61137 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
Astn1Q61137 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Astn1Q61137 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Astn1Q61137 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Astn1Q61137 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Astn1Q61137 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Astn1Q61137 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Astn1Q61137 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Astn1Q61137 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Astn1Q61137 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Astn1Q61137 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Astn1Q61137 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Astn1Q61137 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Astn1Q61137 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Astn1Q61137 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Astn1Q61137 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Astn1Q61137 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Astn1Q61137 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Astn1Q61137 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Astn1Q61137 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Astn1Q61137 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Astn1Q61137 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Astn1Q61137 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Astn1Q61137 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Astn1Q61137 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Astn1Q61137 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Astn1Q61137 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Astn1Q61137 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Astn1Q61137 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Astn1Q61137 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Astn1Q61137 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Astn1Q61137 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Astn1Q61137 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Astn1Q61137 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Astn1Q61137 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Astn1Q61137 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Astn1Q61137 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Astn1Q61137 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Astn1Q61137 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Astn1Q61137 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Astn1Q61137 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Astn1Q61137 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Astn1Q61137 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Astn1Q61137 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Astn1Q61137 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Astn1Q61137 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Astn1Q61137 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Astn1Q61137 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Astn1Q61137 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Astn1Q61137 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Astn1Q61137 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Astn1Q61137 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Astn1Q61137 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Astn1Q61137 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Astn1Q61137 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Astn1Q61137 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Astn1Q61137 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Astn1Q61137 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Astn1Q61137 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Astn1Q61137 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Astn1Q61137 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Astn1Q61137 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Astn1Q61137 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Astn1Q61137 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Astn1Q61137 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Astn1Q61137 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Astn1Q61137 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Astn1Q61137 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Astn1Q61137 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Astn1Q61137 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Astn1Q61137 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Astn1Q61137 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Astn1Q61137 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Astn1Q61137 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Astn1Q61137 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Astn1Q61137 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Astn1Q61137 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Astn1Q61137 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Astn1Q61137 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Astn1Q61137 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Astn1Q61137 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Astn1Q61137 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Astn1Q61137 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Astn1Q61137 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Astn1Q61137 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Astn1Q61137 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Astn1Q61137 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Astn1Q61137 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Astn1Q61137 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Astn1Q61137 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Astn1Q61137 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Astn1Q61137 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Astn1Q61137 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
Astn1Q61137 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Astn1Q61137 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Astn1Q61137 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Astn1Q61137 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Astn1Q61137 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Astn1Q61137 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Astn1Q61137 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms