Protein–RNA interactions for Protein: P41158

Elk4, ETS domain-containing protein Elk-4, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk4P41158 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Elk4P41158 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Elk4P41158 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Elk4P41158 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Elk4P41158 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Elk4P41158 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Elk4P41158 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Elk4P41158 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Elk4P41158 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Elk4P41158 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Elk4P41158 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Elk4P41158 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Elk4P41158 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Elk4P41158 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Elk4P41158 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Elk4P41158 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Elk4P41158 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Elk4P41158 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Elk4P41158 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Elk4P41158 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Elk4P41158 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Elk4P41158 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Elk4P41158 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Elk4P41158 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Elk4P41158 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Elk4P41158 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Elk4P41158 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Elk4P41158 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Elk4P41158 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Elk4P41158 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Elk4P41158 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Elk4P41158 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Elk4P41158 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Elk4P41158 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Elk4P41158 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Elk4P41158 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Elk4P41158 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Elk4P41158 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Elk4P41158 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Elk4P41158 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Elk4P41158 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Elk4P41158 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Elk4P41158 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Elk4P41158 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Elk4P41158 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Elk4P41158 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Elk4P41158 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Elk4P41158 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Elk4P41158 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Elk4P41158 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Elk4P41158 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Elk4P41158 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Elk4P41158 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Elk4P41158 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Elk4P41158 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Elk4P41158 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Elk4P41158 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Elk4P41158 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Elk4P41158 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Elk4P41158 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Elk4P41158 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Elk4P41158 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Elk4P41158 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Elk4P41158 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Elk4P41158 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Elk4P41158 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Elk4P41158 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Elk4P41158 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Elk4P41158 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Elk4P41158 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Elk4P41158 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Elk4P41158 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Elk4P41158 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Elk4P41158 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Elk4P41158 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Elk4P41158 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Elk4P41158 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Elk4P41158 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Elk4P41158 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Elk4P41158 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Elk4P41158 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Elk4P41158 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Elk4P41158 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Elk4P41158 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Elk4P41158 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Elk4P41158 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Elk4P41158 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Elk4P41158 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Elk4P41158 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Elk4P41158 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Elk4P41158 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Elk4P41158 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Elk4P41158 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Elk4P41158 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Elk4P41158 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Elk4P41158 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Elk4P41158 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Elk4P41158 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Elk4P41158 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Elk4P41158 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms