Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
PtprcP06800 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PtprcP06800 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PtprcP06800 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PtprcP06800 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
PtprcP06800 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
PtprcP06800 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PtprcP06800 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PtprcP06800 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PtprcP06800 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PtprcP06800 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36■■■■□ 3.35
PtprcP06800 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PtprcP06800 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PtprcP06800 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtprcP06800 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PtprcP06800 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PtprcP06800 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprcP06800 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtprcP06800 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprcP06800 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprcP06800 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PtprcP06800 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
PtprcP06800 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PtprcP06800 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PtprcP06800 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PtprcP06800 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PtprcP06800 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtprcP06800 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PtprcP06800 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprcP06800 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprcP06800 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprcP06800 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtprcP06800 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PtprcP06800 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PtprcP06800 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtprcP06800 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PtprcP06800 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprcP06800 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PtprcP06800 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprcP06800 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprcP06800 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprcP06800 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprcP06800 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtprcP06800 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprcP06800 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprcP06800 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PtprcP06800 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PtprcP06800 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprcP06800 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprcP06800 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprcP06800 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PtprcP06800 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PtprcP06800 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprcP06800 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprcP06800 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprcP06800 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprcP06800 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprcP06800 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprcP06800 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprcP06800 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PtprcP06800 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprcP06800 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtprcP06800 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtprcP06800 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprcP06800 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprcP06800 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprcP06800 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprcP06800 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PtprcP06800 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprcP06800 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprcP06800 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprcP06800 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprcP06800 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprcP06800 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtprcP06800 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprcP06800 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprcP06800 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PtprcP06800 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprcP06800 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PtprcP06800 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprcP06800 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprcP06800 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprcP06800 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprcP06800 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprcP06800 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprcP06800 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprcP06800 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprcP06800 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PtprcP06800 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PtprcP06800 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprcP06800 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprcP06800 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprcP06800 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprcP06800 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprcP06800 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprcP06800 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprcP06800 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PtprcP06800 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprcP06800 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprcP06800 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms