RNA–Protein interactions for RNA: YOR349W

CIN1, Transcript of Tubulin folding factor D involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN1, Length 3,045 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN1	YOR349W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	DAK2	P43550	591 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	YJR142W	P47173	342 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	CWH41	P53008	833 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	MNR2	P35724	969 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	GRX7	P38068	203 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	YEL023C	P39992	682 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	FIG4	P42837	879 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	TUB4	P53378	473 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	ERF2	Q06551	359 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	NUP82	P40368	713 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	APL6	P46682	809 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	MTO1	P53070	669 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	HUL5	P53119	910 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	UFD2	P54860	961 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
CIN1	YOR349W	DPL1	Q05567	589 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	OXR1	Q08952	273 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	NUD1	P32336	851 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	NPL4	P33755	580 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	VPS35	P34110	944 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	RPA14	P50106	137 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	SUV3	P32580	737 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	UBP12	P39538	1254 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	YEN1	P40028	759 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	MID1	P41821	548 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	YGR122W	P53272	402 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	CYC8	P14922	966 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	ALR1	Q08269	859 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	PHO8	P11491	566 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	BDS1	Q08347	646 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	ISC10	P32645	267 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	TIM54	P47045	478 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	SAM37	P50110	327 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	MDG1	P53885	366 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	RAD4	P14736	754 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	UBP1	P25037	809 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	NTH2	P35172	780 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	CYT1	P07143	309 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	KAR1	P11927	433 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	RPB10	P22139	70 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
CIN1	YOR349W	TIM23	P32897	222 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	ISU2	Q12056	156 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	RAD2	P07276	1031 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	SRM1	P21827	482 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	YBR197C	P38306	217 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	SEC6	P32844	805 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	PTC4	P38089	393 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	HDA3	Q06623	655 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	THI4	P32318	326 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	YHL008C	P38750	627 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	CDC55	Q00362	526 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	PPM2	Q08282	695 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	MPC54	Q08550	464 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	IOC2	Q12072	812 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	MSB4	Q12317	492 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	PRI2	P20457	528 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	IXR1	P33417	597 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	TAT2	P38967	592 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	YNL011C	P53980	444 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	APC11	Q12157	165 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN1	YOR349W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.77
CIN1	YOR349W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.77
CIN1	YOR349W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIN1	YOR349W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIN1	YOR349W	RAM1	P22007	431 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIN1	YOR349W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIN1	YOR349W	AGE1	Q04412	482 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIN1	YOR349W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIN1	YOR349W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIN1	YOR349W	MRC1	P25588	1096 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIN1	YOR349W	VNX1	P42839	908 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIN1	YOR349W	MRPS18	P42847	217 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIN1	YOR349W	DNM1	P54861	757 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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