RNA–Protein interactions for RNA: YMR278W

PRM15, Transcript of Phosphoribomutase, yeast

Gene PRM15, Length 1,869 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRM15	YMR278W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	CLN2	P20438	545 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	APL6	P46682	809 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	PEX21	P50091	288 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	YGL081W	P53156	320 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	BDF2	Q07442	638 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	TSC13	Q99190	310 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	ATG3	P40344	310 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	DNA2	P38859	1522 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PRM15	YMR278W	MNN1	P39106	762 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	RTT106	P40161	455 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	MTO1	P53070	669 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	TAT2	P38967	592 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	DAK2	P43550	591 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	YJR142W	P47173	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	PEX29	Q03370	554 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	VAN1	P23642	535 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	SUV3	P32580	737 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	SOH1	P38633	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	NMA111	P53920	997 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	ISU2	Q12056	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	UBP12	P39538	1254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	SPR3	P41901	512 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	TUB4	P53378	473 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	ERF2	Q06551	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	TEC1	P18412	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	GUT2	P32191	649 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	MNR2	P35724	969 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	ARH1	P48360	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	PPM2	Q08282	695 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	TRS33	Q99394	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	SSN2	P38931	1420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	KEX2	P13134	814 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	FIG4	P42837	879 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	TBF1	Q02457	562 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	YRR1	Q12172	810 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	PEP7	P32609	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	SAP30	P38429	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	HUL5	P53119	910 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	YDL206W	Q12424	762 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	CYC8	P14922	966 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
PRM15	YMR278W	NUP82	P40368	713 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	MDG1	P53885	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	YGR122W	P53272	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	HAP5	Q02516	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	APC11	Q12157	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRM15	YMR278W	UBP1	P25037	809 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	PET112	P33893	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	VPS35	P34110	944 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	CWC24	P53769	259 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
PRM15	YMR278W	YEN1	P40028	759 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	RPA14	P50106	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	HIR3	P47171	1648 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	RAM1	P22007	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	YBR197C	P38306	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	BNI4	P53858	892 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	UFD2	P54860	961 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	AGE1	Q04412	482 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	TOS4	Q06266	489 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	KOG1	P38873	1557 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	RAD2	P07276	1031 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	TIM23	P32897	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	GRX7	P38068	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	SEC6	P32844	805 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	BCK2	P33306	851 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRM15	YMR278W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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