RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	BIO2	P32451	375 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	HXT10	P43581	546 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	KXD1	P53158	218 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	RPO31	P04051	1460 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	SLY41	P22215	453 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	RTS3	P53289	263 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	HST3	P53687	447 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	VPS72	Q03388	795 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	YMR196W	Q04336	1088 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.66	□□□□□ -1.5	not detected
RPS1B	YML063W	IPL1	P38991	367 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	ATG36	P46983	293 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	CHD1	P32657	1468 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	SCJ1	P25303	377 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	ALD2	P47771	506 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	HST2	P53686	357 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	YDR444W	Q04093	687 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	RKR1	Q04781	1562 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	TGL4	P36165	910 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	OSW7	P43611	510 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	RPA14	P50106	137 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	YNL108C	P53929	270 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	YML083C	Q04526	418 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	MRX10	Q05648	414 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	YDL206W	Q12424	762 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	YJR115W	P47152	169 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	PUS6	P53294	404 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	RAD59	Q12223	238 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	SWE1	P32944	819 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	PPX1	P38698	397 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	YPR097W	Q06839	1073 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	ALR1	Q08269	859 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.61	□□□□□ -1.51	not detected
RPS1B	YML063W	YPP1	P46951	817 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	TBF1	Q02457	562 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	YDL176W	Q12027	708 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.6	□□□□□ -1.51	not detected
RPS1B	YML063W	POL32	P47110	350 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	RIM21	P48565	533 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	MMP1	Q12372	583 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	NTE1	Q04958	1679 aa		5.59	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	PAN1	P32521	1480 aa		5.59	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	ERP5	P38819	212 aa		5.59	□□□□□ -1.51
RPS1B	YML063W	BNI1	P41832	1953 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	PEP12	P32854	288 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	TOM20	P35180	183 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	RNH70	P53331	553 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	UBX5	Q06682	500 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	ESS1	P22696	170 aa		5.57	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	MET5	P47169	1442 aa		5.57	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	ATE1	P16639	503 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	YJU3	P28321	313 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	KIP2	P28743	706 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	MGE1	P38523	228 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	YHL050C	P38721	697 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	YHR219W	P38900	624 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	YJR008W	P47085	338 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	POL1	P13382	1468 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	IXR1	P33417	597 aa		5.55	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	YJL049W	P47048	450 aa		5.55	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	YJR107W	P47145	328 aa		5.55	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	MMS22	Q06164	1454 aa		5.55	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52

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