RNA–Protein interactions for RNA: YHR199C-A

NBL1, Transcript of Subunit of the conserved chromosomal passenger complex (CPC), yeast

Gene NBL1, Length 222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NBL1	YHR199C-A	SUM1	P46676	1062 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NBL1	YHR199C-A	MSN5	P52918	1224 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NBL1	YHR199C-A	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NBL1	YHR199C-A	RGA2	Q06407	1009 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NBL1	YHR199C-A	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NBL1	YHR199C-A	SWI5	P08153	709 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NBL1	YHR199C-A	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	NTH2	P35172	780 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	KTR7	P40504	517 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	YFL034W	P43564	1073 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	HPF1	Q05164	967 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	TSC13	Q99190	310 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	TTI1	P36097	1038 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	YPQ2	Q06328	317 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	SIS2	P36024	562 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	JJJ2	P46997	583 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	UBP15	P50101	1230 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	YGR035C	P53222	116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	IRE1	P32361	1115 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	PHO87	P25360	923 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	TRK2	P28584	889 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	CUZ1	P53899	274 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	GAL2	P13181	574 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	HAP4	P14064	554 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	TGL4	P36165	910 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NBL1	YHR199C-A	CYT1	P07143	309 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	LYS5	P50113	272 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	MCM1	P11746	286 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	DIT1	P21623	536 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	CPS1	P27614	576 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	GAS4	Q08271	471 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	PSH1	Q12161	406 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	DPH6	Q12429	685 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	ROM1	P53046	1155 aa		5	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	YNL165W	P53891	406 aa		5	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	JJJ3	P47138	172 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	ECM23	Q02710	187 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	UBP1	P25037	809 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	PUP1	P25043	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	CEM1	P39525	442 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	SYT1	Q06836	1226 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	MRPL16	P38064	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NBL1	YHR199C-A	ALD2	P47771	506 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	VAN1	P23642	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	MLF3	P32047	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	UBX7	P38349	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	HXT5	P38695	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	YTA6	P40328	754 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	SPR3	P41901	512 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	STB3	Q12427	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	SUV3	P32580	737 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	RLF2	Q12495	606 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	RGP1	P16664	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	FPS1	P23900	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	SCD5	P34758	872 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	YML083C	Q04526	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	TRS33	Q99394	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NBL1	YHR199C-A	MDJ1	P35191	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	CWH41	P53008	833 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	MTO1	P53070	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	AI1	P03875	834 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	ICP55	P40051	511 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	YFL066C	P43538	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	CAB1	Q04430	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	KAP122	P32767	1081 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	YBR197C	P38306	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	MSC7	P38694	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	SKP1	P52286	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	THI72	Q08579	599 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	PUN1	Q06991	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	RPC31	P17890	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	NSG2	P53898	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	SRS2	P12954	1174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	MRPL33	P20084	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NBL1	YHR199C-A	VMA3	P25515	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30 ms