RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635555.1

LINC00466-210, long intergenic non-protein coding RNA 466, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00466, Length 1,016 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00466-210ENST00000635555 NBPF26B4DH59 902 aa12.95□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 FCHSD2O94868 740 aa12.95□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 CUX1P39880 1505 aa12.94□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 WNT2BQ93097 391 aa12.94□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 HCSTQ9UBK5 93 aa12.94□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 FAM198AQ9UFP1 575 aa12.94□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 SLC24A1O60721 1099 aa12.93□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa12.93□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 PADI6Q6TGC4 694 aa12.92□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 TATDN2Q93075 761 aa12.92□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 ANKK1Q8NFD2 765 aa12.91□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 HIC1Q14526 733 aa12.9□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 THSD4Q6ZMP0 1018 aa12.9□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
LINC00466-210ENST00000635555 PNMA3Q9UL41 463 aa12.89□□□□□ -0.35
LINC00466-210ENST00000635555 NUDT18Q6ZVK8 323 aa12.87□□□□□ -0.35
LINC00466-210ENST00000635555 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
LINC00466-210ENST00000635555 SOWAHBA6NEL2 793 aa12.85□□□□□ -0.35
LINC00466-210ENST00000635555 SMAPO00193 183 aa12.85□□□□□ -0.35
LINC00466-210ENST00000635555 GPIHBP1Q8IV16 184 aa12.85□□□□□ -0.35
LINC00466-210ENST00000635555 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.85□□□□□ -0.35
LINC00466-210ENST00000635555 IFT140Q96RY7 1462 aa12.85□□□□□ -0.35
LINC00466-210ENST00000635555 C3orf80F5H4A9 247 aa12.83□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 GNPATO15228 680 aa12.83□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 GPR37O15354 613 aa12.82□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 LRCH3Q96II8 777 aa12.82□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 EYA1Q99502 592 aa12.82□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.82□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 PTPN5P54829 565 aa12.81□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP12.8□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 ADGRG1Q9Y653 693 aa12.8□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 OATP04181 439 aa12.78□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 BCAMP50895 628 aa12.78□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 NYAP1Q6ZVC0 841 aa12.78□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 TNIKQ9UKE5 1360 aa12.78□□□□□ -0.36
LINC00466-210ENST00000635555 SAMD7Q7Z3H4 446 aa12.77□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 WDR97A6NE52 1622 aa12.77□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 KIF21BO75037 1637 aa12.77□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 PRXQ9BXM0 1461 aa12.75□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 DNAJB2P25686 324 aa12.73□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 LMOD2Q6P5Q4 547 aa12.73□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 GOLGA3Q08378 1498 aa12.72□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 KIF27Q86VH2 1401 aa12.72□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 FECHP22830 423 aa12.72□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 SLC4A3P48751 1232 aa12.72□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 NECTIN2Q92692 538 aa12.72□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 HPS5Q9UPZ3 1129 aa12.72□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 PPP4CP60510 307 aa12.71□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 SLF2Q8IX21 1173 aa12.71□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 PXYLP1Q8TE99 480 aa12.71□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 WBP1LQ9NX94 342 aa12.71□□□□□ -0.37
LINC00466-210ENST00000635555 IGF1RP08069 1367 aa12.7□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 FAM161AQ3B820 660 aa12.7□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.69□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 RCCD1A6NED2 376 aa12.69□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 TMEM134Q9H6X4 195 aa12.69□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.68□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.67□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 PBRM1Q86U86 1689 aa12.67□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa12.67□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 MAP2K5Q13163 448 aa12.67□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.65□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa12.65□□□□□ -0.38
LINC00466-210ENST00000635555 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
LINC00466-210ENST00000635555 RNF40O75150 1001 aa12.64□□□□□ -0.39
LINC00466-210ENST00000635555 CHD1O14646 1710 aa12.64□□□□□ -0.39
LINC00466-210ENST00000635555 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.64□□□□□ -0.39
LINC00466-210ENST00000635555 CEP162Q5TB80 1403 aa12.63□□□□□ -0.39
LINC00466-210ENST00000635555 BCANQ96GW7 911 aa12.63□□□□□ -0.39
LINC00466-210ENST00000635555 GRIN2BQ13224 1484 aa12.63□□□□□ -0.39
LINC00466-210ENST00000635555 IRF6O14896 467 aa12.62□□□□□ -0.39
LINC00466-210ENST00000635555 UBTFP17480 764 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
LINC00466-210ENST00000635555 IFFO2Q5TF58 517 aa12.6□□□□□ -0.39
LINC00466-210ENST00000635555 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
LINC00466-210ENST00000635555 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
LINC00466-210ENST00000635555 PRR14Q9BWN1 585 aa12.59□□□□□ -0.39
LINC00466-210ENST00000635555 ZMYND10O75800 440 aa12.58□□□□□ -0.4
LINC00466-210ENST00000635555 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
LINC00466-210ENST00000635555 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.58□□□□□ -0.4
LINC00466-210ENST00000635555 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
LINC00466-210ENST00000635555 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.57□□□□□ -0.4
LINC00466-210ENST00000635555 ADAMTS12P58397 1594 aa12.57□□□□□ -0.4
LINC00466-210ENST00000635555 BARGINQ6ZT62 677 aa12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms