RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		24.68	■■□□□ 1.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	24.68	■■□□□ 1.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	24.68	■■□□□ 1.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		24.66	■■□□□ 1.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	24.65	■■□□□ 1.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		24.64	■■□□□ 1.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		24.63	■■□□□ 1.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZFYVE9	O95405	1425 aa		24.63	■■□□□ 1.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	TOM1	O60784	492 aa		24.63	■■□□□ 1.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		24.62	■■□□□ 1.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		24.62	■■□□□ 1.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNA6	P17658	529 aa		24.6	■■□□□ 1.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRPM2	O94759	1503 aa		24.59	■■□□□ 1.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	24.59	■■□□□ 1.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOXD1	Q16676	465 aa		24.58	■■□□□ 1.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	TBX22	Q9Y458	520 aa		24.57	■■□□□ 1.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	24.55	■■□□□ 1.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		24.55	■■□□□ 1.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PIP4K2B	P78356	416 aa		24.54	■■□□□ 1.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		24.54	■■□□□ 1.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLTCL1	P53675	1640 aa		24.53	■■□□□ 1.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		24.53	■■□□□ 1.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIF1B	O60333	1816 aa		24.5	■■□□□ 1.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	24.49	■■□□□ 1.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		24.49	■■□□□ 1.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		24.47	■■□□□ 1.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM94	Q12767	1356 aa		24.46	■■□□□ 1.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		24.45	■■□□□ 1.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	24.45	■■□□□ 1.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	PIK3R4	Q99570	1358 aa		24.44	■■□□□ 1.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	HRC	P23327	699 aa		24.44	■■□□□ 1.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	RGL3	Q3MIN7	710 aa		24.44	■■□□□ 1.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	DIP2A	Q14689	1571 aa		24.44	■■□□□ 1.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	24.44	■■□□□ 1.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	C14orf37	Q86TY3	774 aa		24.42	■■□□□ 1.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		24.41	■■□□□ 1.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		24.4	■■□□□ 1.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	NWD1	Q149M9	1564 aa		24.4	■■□□□ 1.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	24.39	■■□□□ 1.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	MSH6	P52701	1360 aa		24.38	■■□□□ 1.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		24.37	■■□□□ 1.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSPA1L	P34931	641 aa		24.35	■■□□□ 1.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	24.33	■■□□□ 1.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	MET	P08581	1390 aa		24.32	■■□□□ 1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		24.32	■■□□□ 1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		24.31	■■□□□ 1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		24.3	■■□□□ 1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		24.3	■■□□□ 1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTPRU	Q92729	1446 aa		24.3	■■□□□ 1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALK	Q9UM73	1620 aa		24.29	■■□□□ 1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATF3	P18847	181 aa		24.29	■■□□□ 1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		24.29	■■□□□ 1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		24.27	■■□□□ 1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLAIN2	Q9P270	581 aa		24.27	■■□□□ 1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		24.27	■■□□□ 1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPL	O60437	1756 aa		24.26	■■□□□ 1.47
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		24.24	■■□□□ 1.47
JMJD1C-211	ENST00000633035	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		24.2	■■□□□ 1.46
JMJD1C-211	ENST00000633035	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	24.19	■■□□□ 1.46
JMJD1C-211	ENST00000633035	STK26	Q9P289	416 aa		24.16	■■□□□ 1.46
JMJD1C-211	ENST00000633035	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		24.16	■■□□□ 1.46
JMJD1C-211	ENST00000633035	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	24.15	■■□□□ 1.46
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		24.14	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		24.14	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFT172	Q9UG01	1749 aa		24.14	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	PIK3C2G	O75747	1445 aa		24.13	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		24.13	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	DCC	P43146	1447 aa		24.12	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTCH1	Q13635	1447 aa		24.12	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	STAC3	Q96MF2	364 aa		24.12	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	24.12	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		24.12	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	24.12	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	24.11	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		24.1	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		24.1	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYOM2	P54296	1465 aa		24.1	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	24.08	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	24.08	■■□□□ 1.45
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABCC11	Q96J66	1382 aa		24.05	■■□□□ 1.44
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		24.05	■■□□□ 1.44
JMJD1C-211	ENST00000633035	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		24.05	■■□□□ 1.44
JMJD1C-211	ENST00000633035	BRINP3	Q76B58	766 aa		24.04	■■□□□ 1.44
JMJD1C-211	ENST00000633035	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		24.04	■■□□□ 1.44
JMJD1C-211	ENST00000633035	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	24.03	■■□□□ 1.44
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	24.03	■■□□□ 1.44
JMJD1C-211	ENST00000633035	MST1R	Q04912	1400 aa		24.02	■■□□□ 1.44
JMJD1C-211	ENST00000633035	SIRT1	Q96EB6	747 aa		24.01	■■□□□ 1.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	TECPR2	O15040	1411 aa		24.01	■■□□□ 1.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAMC1	P11047	1609 aa		24	■■□□□ 1.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHLPP1	O60346	1717 aa		24	■■□□□ 1.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		24	■■□□□ 1.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	POGK	Q9P215	609 aa		23.98	■■□□□ 1.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	23.98	■■□□□ 1.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		23.97	■■□□□ 1.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	JCAD	Q9P266	1359 aa		23.97	■■□□□ 1.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		23.95	■■□□□ 1.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	NEUROD1	Q13562	356 aa		23.95	■■□□□ 1.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		23.95	■■□□□ 1.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		23.94	■■□□□ 1.42

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